RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 LINC00473A8K010 186 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIR2DS2P43631 304 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 SRPXP78539 464 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2B11Q5JQS5 317 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD300LFQ8TDQ1 290 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 MITD1Q8WV92 249 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM222Q9H0R3 208 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 LY6LH3BQJ8 138 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 CT45A6P0DMU7 189 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 CT45A5P0DMU8 189 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 CT45A7P0DMV0 189 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM187Q14656 261 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPAG16Q8N0X2 631 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 MED28Q9H204 178 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 HILPDAQ9Y5L2 63 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.155e-8■□□□□ 9.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 APOA2P02652 100 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 LINC00205P59089 165 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 LIAT1Q6ZQX7 453 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 LGI3Q8N145 548 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 GLYATL2Q8WU03 294 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 ITPR3Q14573 2671 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 FCGR3BO75015 233 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 AVPP01185 164 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 SAA4P35542 130 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 RTL8BQ17RB0 113 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 MOB3BQ86TA1 216 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF695Q8IW36 515 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF383Q8NA42 475 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 MALSU1Q96EH3 234 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 NABP2Q9BQ15 211 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRR13Q9NZ81 148 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 OOSP1A8MZH6 123 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 UCP1P25874 307 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGDIBP52566 201 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKRD55Q3KP44 614 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 LIN54Q6MZP7 749 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 C18orf12Q96KH6 178 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A0B4J2A0 478 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD5LO43866 347 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 RRASP10301 218 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 SSX2Q16385 188 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR8H3Q8N146 312 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 TEX29Q8N6K0 151 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR4S2Q8NH73 311 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC35D1Q9NTN3 355 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 SHPKQ9UHJ6 478 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 H7C2Y5 167 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPA2P15927 270 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 MC5RP33032 325 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 LPAR6P43657 344 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 NANPQ8TBE9 248 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 DDB2Q92466 427 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB13P51153 203 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 BPIFB3P59826 476 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM268Q5VZI3 342 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 BRD3OSQ6XYD6 125 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 CADM3Q8N126 398 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIP4P2Q8N4L2 257 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 A8MV72 311 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAMP3O60896 148 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDS2O95674 445 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 BCAP31P51572 246 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR5AN1Q8NGI8 311 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM56Q96MV1 263 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 AKAP9Q99996 3911 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 WASHC3Q9Y3C0 194 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM96BQ9Y3D0 163 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 H0YJW9 148 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATG12O94817 140 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF585BQ52M93 769 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL22RA2Q969J5 263 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 CRYZL1O95825 349 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 HPRT1P00492 218 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPNS3Q6ZMD2 512 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDPNQ86YL7 162 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRTM2Q8N967 370 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PPI3 338 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 TIMM23O14925 209 aa22.15■■□□□ 1.14
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