RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 CLN8Q9UBY8 286 aa16.32■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 MGST3O14880 152 aa16.31■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 ELLP55199 621 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 FABP9Q0Z7S8 132 aa16.31■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 ELOBQ15370 118 aa16.31■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 CR1LQ2VPA4 569 aa16.31■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 TPRX1Q8N7U7 411 aa16.31■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 LHX4Q969G2 390 aa16.31■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 PMS2P5A8MQ11 134 aa16.31■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF727A8MUV8 499 aa16.31■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 RPS10P46783 165 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 GNB2P62879 340 aa16.31■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 VWC2Q2TAL6 325 aa16.31■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 TIMM23BQ5SRD1 257 aa16.31■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 RFESDQ8TAC1 157 aa16.31■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 A0A1W2PPE3 182 aa16.3■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 MARCH11A6NNE9 402 aa16.3■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 LINC00473A8K010 186 aa16.3■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 ST8SIA5O15466 376 aa16.3■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 ZG16O60844 167 aa16.3■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 IGHV3-13P01766 116 aa16.3■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 GPR12P47775 334 aa16.3■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 IGFL3Q6UXB1 125 aa16.3■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 SSX7Q7RTT5 188 aa16.3■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa16.3■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa16.3■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 CEBPZOSA8MTT3 80 aa16.3■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 YPEL1O60688 119 aa16.3■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 TFF1P04155 84 aa16.3■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 IGHV3-43DP0DP04 118 aa16.3■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 EDDM3AQ14507 147 aa16.3■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 YPEL2Q96QA6 119 aa16.3■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 RAB9BQ9NP90 201 aa16.3■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 HPRT1P00492 218 aa16.29■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 FGF7P21781 194 aa16.29■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 AARDQ4LEZ3 155 aa16.29■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 SEM1Q6ZVN7 128 aa16.29■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF709Q8N972 641 aa16.29■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 R3HDM4Q96D70 268 aa16.29■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa16.29■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 GNG12Q9UBI6 72 aa16.29■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa16.29■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 C17orf112F2Z3M2 114 aa16.29■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 SOX15O60248 233 aa16.29■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 DUTP33316 252 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 RPP30P78346 268 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 MORN2Q502X0 79 aa16.29■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 Q8WTZ3 238 aa16.29■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 SDF2L1Q9HCN8 221 aa16.29■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 DUSP13Q9UII6 198 aa16.29■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 DEFB108AA8MXU0 73 aa16.28■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP16.28■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 CRYAAP02489 173 aa16.28■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 CD55P08174 381 aa16.28■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 GLRXP35754 106 aa16.28■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 TGOLN2O43493 480 aa16.27■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 EGR1P18146 543 aa16.27■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 PSMB3P49720 205 aa16.27■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 OR10G9Q8NGN4 311 aa16.27■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 OR10G7Q8NGN6 311 aa16.27■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 OR13D1Q8NGV5 346 aa16.27■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 ZDHHC16Q969W1 377 aa16.27■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 CTDSP1Q9GZU7 261 aa16.27■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 GTF3C1Q12789 2109 aa16.27■□□□□ 0.2
SPNS1-201ENST00000311008 CLDN34H7C241 214 aa16.27■□□□□ 0.19
SPNS1-201ENST00000311008 F2RL2O00254 374 aa16.27■□□□□ 0.19
SPNS1-201ENST00000311008 KIR2DS2P43631 304 aa16.27■□□□□ 0.19
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF83P51522 516 aa16.27■□□□□ 0.19
SPNS1-201ENST00000311008 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.19
SPNS1-201ENST00000311008 ACSM6Q6P461 480 aa16.27■□□□□ 0.19
SPNS1-201ENST00000311008 FAM180AQ6UWF9 173 aa16.27■□□□□ 0.19
SPNS1-201ENST00000311008 MANBALQ9NQG1 85 aa16.27■□□□□ 0.19
SPNS1-201ENST00000311008 OR6C3Q9NZP0 311 aa16.27■□□□□ 0.19
SPNS1-201ENST00000311008 URB1O60287 2271 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM250H0YL14 139 aa16.26■□□□□ 0.19
SPNS1-201ENST00000311008 ITGB1BP1O14713 200 aa16.26■□□□□ 0.19
SPNS1-201ENST00000311008 IGKV1D-33P01593 117 aa16.26■□□□□ 0.19
SPNS1-201ENST00000311008 IGKV1-33P01594 117 aa16.26■□□□□ 0.19
SPNS1-201ENST00000311008 NQO2P16083 231 aa16.26■□□□□ 0.19
SPNS1-201ENST00000311008 RND2P52198 227 aa16.26■□□□□ 0.19
SPNS1-201ENST00000311008 NUBP1P53384 320 aa16.26■□□□□ 0.19
SPNS1-201ENST00000311008 ERVFRD-1P60508 538 aa16.26■□□□□ 0.19
SPNS1-201ENST00000311008 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
SPNS1-201ENST00000311008 NCR3LG1Q68D85 454 aa16.26■□□□□ 0.19
SPNS1-201ENST00000311008 GCSAMQ8N6F7 178 aa16.26■□□□□ 0.19
SPNS1-201ENST00000311008 MEGF10Q96KG7 1140 aa16.26■□□□□ 0.19
SPNS1-201ENST00000311008 DCTN5Q9BTE1 182 aa16.26■□□□□ 0.19
SPNS1-201ENST00000311008 NPCDR1Q9BY65 106 aa16.26■□□□□ 0.19
SPNS1-201ENST00000311008 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa16.26■□□□□ 0.19
SPNS1-201ENST00000311008 M0R1B8 84 aa16.26■□□□□ 0.19
SPNS1-201ENST00000311008 MDKP21741 143 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF674Q2M3X9 581 aa16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms