RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 CLEC18AA5D8T8 446 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 C17orf98A8MV24 154 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 OVOL3O00110 214 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 IGKV1-5P01602 117 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 S100A11P31949 105 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 Q6ZRM9 215 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 CLEC18CQ8NCF0 446 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM216AQ8WUB2 273 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF251Q9BRH9 671 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 CHODLQ9H9P2 273 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB9BQ9NP90 201 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 MSGN1A6NI15 193 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 PPIHO43447 177 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 CLDN1O95832 211 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 F12P00748 615 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 DUTP33316 252 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR12P47775 334 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 S100A10P60903 97 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM155Q4W5P6 130 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2B11Q5JQS5 317 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 FOXRED2Q8IWF2 684 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 GSX2Q9BZM3 304 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 ARL6Q9H0F7 186 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 DEDDO75618 318 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 AKR1C2P52895 323 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 AKR1C1Q04828 323 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF345Q14585 488 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 NCR3LG1Q68D85 454 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 DCUN1D4Q92564 292 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 LPAR3Q9UBY5 353 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 SPG11Q96JI7 2443 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 RNF212BA8MTL3 300 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 K7EPK0 472 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 GNG10P50151 68 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF66Q6ZN08 573 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNRGQ8N5I3 272 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 OR10A7Q8NGE5 316 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR146Q96CH1 333 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 GAB2Q9UQC2 676 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 FBN2P35556 2912 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 SNAPC5O75971 98 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 SCGB1D2O95969 90 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 FOSL1P15407 271 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 LPAR6P43657 344 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM33P57088 247 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM30BQ3MIR4 351 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB1CQ92928 201 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 PITX3O75364 302 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2F2O95006 317 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB7AP51149 207 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2F1Q13607 317 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 SPAG16Q8N0X2 631 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 PFDN2Q9UHV9 154 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 GOSR1O95249 250 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 EFNA4P52798 201 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 TLE4Q04727 773 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 CATR1Q13166 79 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 CLLU1Q5K131 121 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 DMBX1Q8NFW5 382 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 DDB2Q92466 427 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 TIMD4Q96H15 378 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 MIOXQ9UGB7 285 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 CELSR2Q9HCU4 2923 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 H7C2Y5 167 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 M0R1X1 148 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 S1PR2O95136 353 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 P0C879 139 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 LYG1Q8N1E2 194 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 MED13LQ71F56 2210 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A0D9SG52 128 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 F8W036 122 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB29O14966 203 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 PET100P0DJ07 73 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 ID3Q02535 119 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 LILRB2Q8N423 598 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 128.6 ms