RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000108593.7

Ctdnep1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdnep1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 GdnfP48540 211 aa25.27■■□□□ 1.64
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Stub1Q9WUD1 304 aa25.27■■□□□ 1.64
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ssbp3Q9D032 388 aa25.24■■□□□ 1.63
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vmn1r181Q0P547 304 aa25.23■■□□□ 1.63
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mettl21eQ8CDZ2 244 aa25.23■■□□□ 1.63
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 4930555G01RikL7N253 205 aa25.22■■□□□ 1.63
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Eif4eP63073 217 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vash1Q8C1W1 375 aa25.22■■□□□ 1.63
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 CdnfQ8CC36 187 aa25.22■■□□□ 1.63
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Egr3P43300 387 aa25.2■■□□□ 1.62
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Thap4Q6P3Z3 569 aa25.2■■□□□ 1.62
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PurgQ8R4E6 350 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Atxn7l3A2AWT3 347 aa25.19■■□□□ 1.62
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm7849D3YX03 116 aa25.19■■□□□ 1.62
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 P01630 113 aa25.19■■□□□ 1.62
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