RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000004430.13

Clcn3-201, Transcript of H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clcn3, Length 4,175 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn3-201ENSMUST00000004430 PmchP56942 165 aa11.2□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Zfp235Q499D5 702 aa11.2□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr804Q7TRH7 314 aa11.2□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 SheQ8BSD5 492 aa11.2□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Slc25a1Q8JZU2 311 aa11.2□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 FuomQ8R2K1 153 aa11.2□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr559Q8VH14 318 aa11.2□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Washc3Q9CR27 194 aa11.2□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm5218F6YH22 154 aa11.2□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Tcf21O35437 179 aa11.2□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 H3f3cP02301 136 aa11.2□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 H3f3aP84244 136 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr1442Q0VEV7 312 aa11.2□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr56Q8VGD6 315 aa11.2□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Rab31Q921E2 194 aa11.2□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Q9DAE8 263 aa11.2□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Q9DAF8 208 aa11.2□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Plekha3Q9ERS4 297 aa11.2□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Tnfsf14Q9QYH9 239 aa11.2□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Sptbn2Q68FG2 2388 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Lrrc3cA0A1B0GRI5 255 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Cd79aP11911 220 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Ier3P46694 153 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Pcbd1P61458 104 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Faap20Q3UN58 186 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Msl2Q69ZF8 577 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Scrt2Q8BTH6 311 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 EogtQ8BYW9 527 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 C1ql2Q8CFR0 287 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Rdh9Q8K5C8 317 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr1447Q8VFX3 309 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Lyzl6Q9DA11 148 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 MpdzQ8VBX6 2055 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm5225J3QPL3 108 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 S100a10P08207 97 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Pip5k1aP70182 546 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Q3U6N9 222 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Slc22a14Q497L9 629 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Elavl2Q60899 360 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Slc25a47Q6IS41 310 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Q80W69 301 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Dmrta1Q8CFG4 490 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Vmn1r4Q8R2D3 297 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr878Q9EQA9 314 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Ndufaf3Q9JKL4 185 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Fbxl17Q9QZN1 701 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Kcne4Q9WTW3 170 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Ighv5-12A0A075B5Q4 117 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm10358A0A1D5RLD8 333 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr221B2RVX8 311 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 GapdhP16858 333 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Hmga2P52927 108 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Ube2nP61089 152 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Slc39a7Q31125 476 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Kcnip4Q6PHZ8 250 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Fbll1Q80WS3 314 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Paqr8Q80ZE5 354 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Mospd3Q8BGG6 235 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Parp11Q8CFF0 331 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Lyrm2Q8R033 88 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr1444Q8VFX2 319 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Fdx2Q9CPW2 174 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Fzd5Q9EQD0 585 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm3839S4R1W1 333 aa11.19□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Psg20E9Q9B4 475 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr203L7N205 307 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Htr5aP30966 357 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm7534Q3UU21 679 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Bahd1Q497V6 772 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Tmem42Q9CR22 157 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Hdhd3Q9CYW4 251 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Lipt2Q9D009 231 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Asb5Q9D1A4 329 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Tspan32Q9JHH2 256 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Mapk7Q9WVS8 806 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Wnt1P04426 370 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Ifna7P06799 190 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Cox5aP12787 146 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 LalbaP29752 143 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Npy4rQ61041 375 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 SspnQ62147 216 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gpr135Q7TQP2 457 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Vmn1r178Q8R2B6 304 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr469Q8VF66 314 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr1002Q8VFK2 318 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Chst1Q9EQC0 411 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Nova1Q9JKN6 507 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Fcrl6A1YIY0 268 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 MiipA2A7Y5 387 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Arxes1C0HK79 180 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Arxes2C0HK80 180 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr335-psQ7TRY6 312 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Rpusd1Q8VCZ8 306 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Rwdd3Q8VIL2 267 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Scgb1b27Q91WB5 92 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Cpn1Q9JJN5 457 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Dock10Q8BZN6 2150 aa11.18□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 4931422A03RikA2BHN9 113 aa11.17□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Ighg2cF6TQW2 404 aa11.17□□□□□ -0.62
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr194L7N1Y8 306 aa11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43.7 ms