RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 Q8N7P7 452 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5M8Q8NGP6 311 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 OR51H1Q8NH63 302 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 CLEC7AQ9BXN2 247 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 GOSR2O14653 212 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 TOR1AO14656 332 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 CDS2O95674 445 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 BTNL3Q6UXE8 466 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 BEND2Q8NDZ0 799 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 OR13D1Q8NGV5 346 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 ADTRPQ96IZ2 230 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 FASNP49327 2511 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PPE3 182 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2A4O95047 310 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 RPA2P15927 270 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 IL3RAP26951 378 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF137PP52743 207 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 TCTE3Q8IZS6 198 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM186Q96B77 213 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2A7Q96R45 310 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 APCP25054 2843 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 ABCA2Q9BZC7 2435 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM157AC9JC47 383 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 PROP1O75360 226 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 GIPP09681 153 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 DUTP33316 252 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 OR10X1Q8NGY0 326 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 CD300LFQ8TDQ1 290 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 GPHA2Q96T91 129 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF251Q9BRH9 671 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 SERPINE2P07093 398 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 MED13LQ71F56 2210 aa25.33■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 M0R1X1 148 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 IFNA21P01568 189 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 IGLV1-47P01700 117 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 C2orf68Q2NKX9 166 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF695Q8IW36 515 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 C1orf159Q96HA4 380 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 C18orf12Q96KH6 178 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 TMED3Q9Y3Q3 217 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 KIR2DS2P43631 304 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 THBS3P49746 956 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 RAP2BP61225 183 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL39P5Q59GN2 51 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 Q5PR19 223 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 GSG1LQ6UXU4 331 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 OR11H6Q8NGC7 330 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 SIRPDQ9H106 197 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 PRR13Q9NZ81 148 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 NAV2Q8IVL1 2488 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 H2BFSP57053 126 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 HLA-DRB5Q30154 266 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 MMP26Q9NRE1 261 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 POLQO75417 2590 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 A8MV72 311 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL30P62888 115 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 CYCSP99999 105 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM268Q5VZI3 342 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 NCR3LG1Q68D85 454 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 INSIG2Q9Y5U4 225 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A096LNT2 108 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00473A8K010 186 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 LHFPL5Q8TAF8 219 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 B4DSR2 109 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 HOXB5P09067 269 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 CD300CQ08708 224 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 SPAG16Q8N0X2 631 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAP1O75689 374 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 ATG12O94817 140 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 MMP9P14780 707 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 VDAC1P21796 283 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF585BQ52M93 769 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 VMO1Q7Z5L0 202 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC35G3Q8N808 338 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 DDB2Q92466 427 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 PDCD10Q9BUL8 212 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 SIRT7Q9NRC8 400 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-206ENST00000588815 CR1P17927 2039 aa25.26■■□□□ 1.63
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