RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 CXorf65A6NEN9 183 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 DEFB108AA8MXU0 73 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 B4DEV8 164 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 IFNA1P01562 189 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 MBP02144 154 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 IFNA4P05014 189 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 PGA5P0DJD9 388 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 CBR1P16152 277 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 COX5AP20674 150 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 LMO1P25800 156 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 SNCAP37840 140 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 SULT1A1P50225 295 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 RAB5BP61020 215 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 PPP1CBP62140 327 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 PMS2P11Q13670 270 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 ATP6V1FQ16864 119 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 SMIM21Q3B7S5 101 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 ZNF497Q6ZNH5 498 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 RNF144BQ7Z419 303 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 NAXEQ8NCW5 288 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 MAFIPQ8WZ33 124 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 ATP5SQ99766 215 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 BIN3Q9NQY0 253 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 C19orf12Q9NSK7 152 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 MTCH1Q9NZJ7 389 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 A0A096LPE4 126 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 A0A1W2PPZ6 126 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 OOEPA6NGQ2 149 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 NXPH2O95156 264 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 IL18BPO95998 194 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 IGKV3-15P01624 115 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 MT-ND4LP03901 98 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 ZNF44P15621 663 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 KITLGP21583 273 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 LPAR6P43657 344 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 ERVK11-1P61568 191 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 RPS23P62266 143 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 RPP30P78346 268 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 ZNF616Q08AN1 781 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 AVPI1Q5T686 147 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 SLC35E4Q6ICL7 350 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 OR10Z1Q8NGY1 313 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 FGFBP3Q8TAT2 258 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 GALMQ96C23 342 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 TP53RKQ96S44 253 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 CLCF1Q9UBD9 225 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 A0A087WWC5 75 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 A0A1B0GWJ7 208 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 SCO1O75880 301 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 ADH4P08319 380 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 PATE4P0C8F1 98 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 ANOS1P23352 680 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 GCH1P30793 250 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 CFHR2P36980 270 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 RFC3P40938 356 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 KIR2DS2P43631 304 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 NPBWR2P48146 333 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 PPT1P50897 306 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 S100A12P80511 92 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 GUSBP1Q15486 140 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 SSX2Q16385 188 aa6.74□□□□□ -1.33
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