RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 Q8N402 240 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 POC5Q8NA72 575 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 NPBQ8NG41 125 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 NABP2Q9BQ15 211 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 SLA2Q9H6Q3 261 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 ING4Q9UNL4 249 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 DAPL1A0PJW8 107 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 OR4C45A6NMZ5 311 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 J3QLW9 94 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 FKBP6O75344 327 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 SCGB2A1O75556 95 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 DCTN3O75935 186 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 NDUFA3O95167 84 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 TRGV3P03979 118 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF19P17023 458 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 RAB3AP20336 220 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 RBM11P57052 281 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 SYNJ2BPP57105 145 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 CD81P60033 236 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 IRF3Q14653 427 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 TATDN3Q17R31 274 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 NHLRC3Q5JS37 347 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 C6orf183Q5T699 404 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF497Q6ZNH5 498 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 KCTD9Q7L273 389 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 LINC00596Q86U02 117 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 PARP16Q8N5Y8 322 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 OR52N1Q8NH53 320 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 OR1L1Q8NH94 360 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 CD300LFQ8TDQ1 290 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM106AQ96A25 262 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 NSL1Q96IY1 281 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 METTL9Q9H1A3 318 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 FBXL15Q9H469 300 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 IZUMO1RA6ND01 250 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 NUPR2A6NF83 97 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 FCN1O00602 326 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 RRHO14718 337 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 SLC16A6O15403 523 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 CDRT1O95170 752 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 HBZP02008 142 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 M6PRP20645 277 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 MED22Q15528 200 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 MPV17LQ2QL34 196 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 AKIRIN2Q53H80 203 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 ASCL4Q6XD76 172 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 IL34Q6ZMJ4 242 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 LFNGQ8NES3 379 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 OR5T1Q8NG75 326 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 OR4K15Q8NH41 348 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 GATAD1Q8WUU5 269 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 MITD1Q8WV92 249 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 NRG4Q8WWG1 115 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 RDH12Q96NR8 316 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 CLCC1Q96S66 551 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 S100A13Q99584 98 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 NEURL2Q9BR09 285 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 OR2S2Q9NQN1 319 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF446Q9NWS9 450 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 A0A0G2JLM5 398 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 MCRIP1C9JLW8 97 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 TFAP2AP05549 437 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 CSN3P07498 182 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 SERPINA2P20848 420 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 MORN2Q502X0 79 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 CST9LP1Q5W188 147 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 ODF3L1Q8IXM7 274 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 DEFB125Q8N687 156 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 OR52L2PQ8NGH6 319 aa6.91□□□□□ -1.3
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