RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567843.1

GTF3C1-208, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTF3C1, Length 474 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1-208ENST00000567843 ISYNA1Q9NPH2 558 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 C12orf4Q9NQ89 552 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 V9GY05 133 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 SHISA3A0PJX4 238 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 SMIM30A4D0T7 59 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 RRHO14718 337 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 SOX15O60248 233 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 PROP1O75360 226 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 NDUFA3O95167 84 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 IGLV1-40P01703 118 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 ZBTB25P24278 435 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 RAB9AP51151 201 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 TRAM1Q15629 374 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 SSX1Q16384 188 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 C9orf66Q5T8R8 295 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 UBE2E2Q96LR5 201 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 MS4A10Q96PG2 267 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 SCOCQ9UIL1 159 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 HSF4Q9ULV5 492 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 VSIG4Q9Y279 399 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 WASHC3Q9Y3C0 194 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 COL7A1Q02388 2944 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 OR5H14A6NHG9 310 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 TRDCB7Z8K6 153 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 I3L521 148 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 BET1O15155 118 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 LDLRAD4O15165 306 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 IGHV3-11P01762 117 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 RPS16P62249 146 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 FHL3Q13643 280 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 PSG5Q15238 335 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 IGSF11Q5DX21 431 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 FAM71F2Q6NXP2 309 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 ZNF383Q8NA42 475 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 MINDY2Q8NBR6 621 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 OR56B1Q8NGI3 324 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 OR5AN1Q8NGI8 311 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 MYOZ3Q8TDC0 251 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 EDARADDQ8WWZ3 215 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 ASCL2Q99929 193 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 B9D2Q9BPU9 175 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 ACOT13Q9NPJ3 140 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 TPSG1Q9NRR2 321 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 RDH8Q9NYR8 311 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 ZNF221Q9UK13 617 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 KCNK7Q9Y2U2 307 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 TENM3Q9P273 2699 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 M0R1X1 148 aa9.48□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 LY86O95711 162 aa9.48□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 CA2P00918 260 aa9.48□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 IGKV1-16P04430 117 aa9.48□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 OR8U9P0C7N5 309 aa9.48□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 GSTT2P0CG29 244 aa9.48□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 GSTT2BP0CG30 244 aa9.48□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 GNB3P16520 340 aa9.48□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 MC5RP33032 325 aa9.48□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 SLURP1P55000 103 aa9.48□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 ZNF616Q08AN1 781 aa9.48□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa9.48□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 ZNF367Q7RTV3 350 aa9.48□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 PPP1R27Q86WC6 154 aa9.48□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 LFNGQ8NES3 379 aa9.48□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 DCUN1D4Q92564 292 aa9.48□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 RAB3CQ96E17 227 aa9.48□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa9.48□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 VCX3BQ9H321 246 aa9.48□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 ZNF580Q9UK33 172 aa9.48□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 RAB22AQ9UL26 194 aa9.48□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa9.47□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 A0A087WW49 117 aa9.47□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 J3QRK9 145 aa9.47□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 ITGB1BP1O14713 200 aa9.47□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 PDCD5O14737 125 aa9.47□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 FABP7O15540 132 aa9.47□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 SLC25A17O43808 307 aa9.47□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 RAMP3O60896 148 aa9.47□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 TFAP2AP05549 437 aa9.47□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 C19orf54Q5BKX5 351 aa9.47□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 C22orf42Q6IC83 251 aa9.47□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 GRPEL2Q8TAA5 225 aa9.47□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 PTX4Q96A99 478 aa9.47□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 MGAT4AQ9UM21 535 aa9.47□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa9.47□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 SORL1Q92673 2214 aa9.46□□□□□ -0.89
GTF3C1-208ENST00000567843 IFITM5A6NNB3 132 aa9.46□□□□□ -0.9
GTF3C1-208ENST00000567843 RBBP9O75884 186 aa9.46□□□□□ -0.9
GTF3C1-208ENST00000567843 APOA2P02652 100 aa9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms