RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561514.1

PALB2-202, Transcript of partner and localizer of BRCA2, humanhuman

TSL 5

Gene PALB2, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2-202ENST00000561514 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 HOXB5P09067 269 aa6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 HOXA5P20719 270 aa6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 FGF7P21781 194 aa6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 GABRR1P24046 479 aa6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 G0S2P27469 103 aa6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 TGFBR1P36897 503 aa6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 GLP1RP43220 463 aa6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 CRISP1P54107 249 aa6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 BDH1Q02338 343 aa6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 IL18Q14116 193 aa6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 ZNF146Q15072 292 aa6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 VAX1Q5SQQ9 334 aa6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 TMUB2Q71RG4 321 aa6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 COMMD2Q86X83 199 aa6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 PRSS35Q8N3Z0 413 aa6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 GGHQ92820 318 aa6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 ARL11Q969Q4 196 aa6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 C10orf35Q96D05 121 aa6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 OR2A7Q96R45 310 aa6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 CLEC7AQ9BXN2 247 aa6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 BARHL1Q9BZE3 327 aa6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 CHST5Q9GZS9 411 aa6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 CLN6Q9NWW5 311 aa6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 TVP23BQ9NYZ1 205 aa6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 OR14J1Q9UGF5 321 aa6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.71□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 M0R143 59 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 TMEM127O75204 238 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 GATBO75879 557 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 OR2F2O95006 317 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 TCRBP04435 133 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 AMY1AP04745 511 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 AMY2AP04746 511 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 IL5P05113 134 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 OR8U8P0C7N1 319 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 ZNF44P15621 663 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 IGLL1P15814 213 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 PRKACGP22612 351 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 HTR2CP28335 458 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 MAS1LP35410 378 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 FUT6P51993 359 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 OR12D2P58182 307 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 ACTA2P62736 377 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 ACTG2P63267 376 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 ACTC1P68032 377 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 ACTA1P68133 377 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 BLOC1S1P78537 153 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 GPR176Q14439 515 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 ZNF345Q14585 488 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 UBE2V2Q15819 145 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 C12orf73Q69YU5 71 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 CNIH2Q6PI25 160 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 CATSPERDQ86XM0 798 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 SLC35F2Q8IXU6 374 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 Q8IYB0 196 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 OR5AU1Q8NGC0 362 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 OR52N4Q8NGI2 321 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 NEK7Q8TDX7 302 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 APH1BQ8WW43 257 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 MISP3Q96FF7 219 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 AKR1E2Q96JD6 320 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 OR14A2Q96R54 314 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 ABCG5Q9H222 651 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 IKZF2Q9UKS7 526 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 HHLA2Q9UM44 414 aa6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 ZAR1LA6NP61 321 aa6.69□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 MGST3O14880 152 aa6.69□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 PSPNO60542 156 aa6.69□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 MMP23AO75900 390 aa6.69□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 CDRT1O95170 752 aa6.69□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 HAND1O96004 215 aa6.69□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 IGHA1P01876 353 aa6.69□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 PPBPP02775 128 aa6.69□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 CD33P20138 364 aa6.69□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 HTR1DP28221 377 aa6.69□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 OR3A1P47881 315 aa6.69□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 DAPP51397 102 aa6.69□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 CCR6P51684 374 aa6.69□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 EDDM3BP56851 147 aa6.69□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 KRTAP10-11P60412 298 aa6.69□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 CDC42P60953 191 aa6.69□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 VAMP2P63027 116 aa6.69□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 ST3GAL4Q11206 333 aa6.69□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 SPHARQ15513 63 aa6.69□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 MED22Q15528 200 aa6.69□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 TRAM1Q15629 374 aa6.69□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 SPIN3Q5JUX0 258 aa6.69□□□□□ -1.34
PALB2-202ENST00000561514 TMEM244Q5VVB8 128 aa6.69□□□□□ -1.34
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