RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 ACTBP60709 375 aa0.19□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 ACTG1P63261 375 aa0.19□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 GLO1Q04760 184 aa0.19□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 AHSA2Q719I0 299 aa0.19□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 C15orf53Q8NAA6 179 aa0.19□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 OR11H2Q8NH07 326 aa0.19□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 OR51H1Q8NH63 302 aa0.19□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 SMCR5Q8TEV8 140 aa0.19□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 CYGBQ8WWM9 190 aa0.19□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 RORBQ92753 470 aa0.19□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 LRRC39Q96DD0 335 aa0.19□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 ABHD14BQ96IU4 210 aa0.19□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 MED18Q9BUE0 208 aa0.19□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 UBQLN4Q9NRR5 601 aa0.19□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 F8W036 122 aa0.18□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 STK16O75716 305 aa0.18□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 CIAO1O76071 339 aa0.18□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 NDUFB2O95178 105 aa0.18□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 CST4P01036 141 aa0.18□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 GPX2P18283 190 aa0.18□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 ATP6V0CP27449 155 aa0.18□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 TAS2R45P59539 299 aa0.18□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 XIAPP98170 497 aa0.18□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 LGALS9BQ3B8N2 356 aa0.18□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM155Q4W5P6 130 aa0.18□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 DRAM2Q6UX65 266 aa0.18□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP0.18□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM239Q8WW34 195 aa0.18□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 ACY3Q96HD9 319 aa0.18□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 FAM210AQ96ND0 272 aa0.18□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 CATSPER2Q96P56 530 aa0.18□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 ACBD6Q9BR61 282 aa0.18□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 MED9Q9NWA0 146 aa0.18□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 GLS2Q9UI32 602 aa0.18□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 STK38LQ9Y2H1 464 aa0.18□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 EML5Q05BV3 1969 aa0.17□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 A0A1B0GW15 77 aa0.17□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 GOLGA8IPA6NC78 632 aa0.17□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 EFCAB9A8MZ26 197 aa0.17□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 BHLHE40O14503 412 aa0.17□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 SGCEO43556 437 aa0.17□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 UGT2B11O75310 529 aa0.17□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 CCL2P13500 99 aa0.17□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 SULT1A2P50226 295 aa0.17□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 UBE2KP61086 200 aa0.17□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 Q1T7F1 81 aa0.17□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 TBC1D28Q2M2D7 210 aa0.17□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM42Q69YG0 159 aa0.17□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 XKRXQ6PP77 449 aa0.17□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 AMTNQ6UX39 209 aa0.17□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 SPATA12Q7Z6I5 190 aa0.17□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 SLC35E3Q7Z769 313 aa0.17□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 GID4Q8IVV7 300 aa0.17□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 Q8N2B8 174 aa0.17□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa0.17□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP0.17□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 ODF3Q96PU9 254 aa0.17□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 MIEN1Q9BRT3 115 aa0.17□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 UGT2B28Q9BY64 529 aa0.17□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 MED28Q9H204 178 aa0.17□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 DNAJC12Q9UKB3 198 aa0.17□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP0.17□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 KIAA0232Q92628 1395 aa0.17□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 NAV2Q8IVL1 2488 aa0.16□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 GRIN2BQ13224 1484 aa0.16□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 APCP25054 2843 aa0.16□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 M0QYV0 167 aa0.16□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 CYTH3O43739 400 aa0.16□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 UCHL1P09936 223 aa0.16□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 OR13C7P0DN81 318 aa0.16□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 AKR1C3P42330 323 aa0.16□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 TAS2R30P59541 319 aa0.16□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 MESTQ5EB52 335 aa0.16□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 C9orf163Q8N9P6 203 aa0.16□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 OR2D3Q8NGH3 330 aa0.16□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 SLC2A9Q9NRM0 540 aa0.16□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 ENPP5Q9UJA9 477 aa0.16□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 LAMA4Q16363 1823 aa0.15□□□□□ -2.38
FAM227B-211ENST00000560557 NPATQ14207 1427 aa0.15□□□□□ -2.39
FAM227B-211ENST00000560557 MAST4O15021 2626 aa0.15□□□□□ -2.39
FAM227B-211ENST00000560557 MEIKINA0A087WXM9 373 aa0.15□□□□□ -2.39
FAM227B-211ENST00000560557 SYNGR1O43759 233 aa0.15□□□□□ -2.39
FAM227B-211ENST00000560557 GP1BAP07359 652 aa0.15□□□□□ -2.39
FAM227B-211ENST00000560557 LIMS3P0CW19 117 aa0.15□□□□□ -2.39
FAM227B-211ENST00000560557 LIMS4P0CW20 117 aa0.15□□□□□ -2.39
FAM227B-211ENST00000560557 IL9P15248 144 aa0.15□□□□□ -2.39
FAM227B-211ENST00000560557 NQO2P16083 231 aa0.15□□□□□ -2.39
FAM227B-211ENST00000560557 OR10J1P30954 320 aa0.15□□□□□ -2.39
FAM227B-211ENST00000560557 RCVRNP35243 200 aa0.15□□□□□ -2.39
FAM227B-211ENST00000560557 IFNGR2P38484 337 aa0.15□□□□□ -2.39
FAM227B-211ENST00000560557 STC1P52823 247 aa0.15□□□□□ -2.39
FAM227B-211ENST00000560557 CARD18P57730 90 aa0.15□□□□□ -2.39
FAM227B-211ENST00000560557 SNAP25P60880 206 aa0.15□□□□□ -2.39
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM258P61165 79 aa0.15□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms