RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557511.5

PSEN1-223, Transcript of presenilin 1, human

TSL 5 BASIC

Gene PSEN1, Length 1,230 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSEN1-223	ENST00000557511	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		6.65	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		6.65	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	OR5H14	A6NHG9	310 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	FAM25A	B3EWG3	89 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	FAM25C	B3EWG5	89 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	FAM25G	B3EWG6	89 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	RBBP9	O75884	186 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	SLC22A5	O76082	557 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	GABARAP	O95166	117 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	OPN1MW	P04001	364 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	TFAP2A	P05549	437 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	CSF1	P09603	554 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	OR8U9	P0C7N5	309 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	GSTT2	P0CG29	244 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	GSTT2B	P0CG30	244 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	SMIM18	P0DKX4	95 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	TGFBR1	P36897	503 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	OR3A3	P47888	321 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	NCS1	P62166	190 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	LSAMP	Q13449	338 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	EBI3	Q14213	229 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	IGSF11	Q5DX21	431 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	CNIH2	Q6PI25	160 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	MFSD4A	Q8N468	514 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	OR8U1	Q8NH10	309 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	CMTM3	Q96MX0	182 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	NABP2	Q9BQ15	211 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	ABCG5	Q9H222	651 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	RNF150	Q9ULK6	438 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	STAB1	Q9NY15	2570 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511		M0R1X1	148 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	XRCC3	O43542	346 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	PRSS3	P35030	304 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	BEST4	Q8NFU0	473 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	CYYR1	Q96J86	154 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	OR2D2	Q9H210	308 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	PSMB11	A5LHX3	300 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	CCDC160	A6NGH7	325 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511		J3QRK9	145 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	AP4M1	O00189	453 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	NBR2	O15453	112 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	RGS5	O15539	181 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	PAX4	O43316	350 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	APOA1	P02647	267 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	OR5H8	P0DN80	308 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	RRAS	P10301	218 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	VDAC1	P21796	283 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	ALDH3B2	P48448	385 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	THBS3	P49746	956 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	TMBIM6	P55061	237 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	TAS2R20	P59543	309 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	ACTB	P60709	375 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	RTL8B	Q17RB0	113 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	PRR31	Q5SQ13	230 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511		Q6ZPA2	131 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSEN1-223	ENST00000557511	REC114	Q7Z4M0	266 aa		6.62	□□□□□ -1.35

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