RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 C5orf63A6NC05 138 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 OR6C6A6NF89 314 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 SGCEO43556 437 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 TSHBP01222 138 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 IGHV4-59P01825 116 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 ACSM4P0C7M7 580 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 CCL1P22362 96 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 CAV3P56539 151 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 OR10A3P58181 314 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 PSG4Q00888 419 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 MXD1Q05195 221 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 GAGE5Q13069 117 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 GAGE6Q13070 117 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF154Q13106 437 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 SGCAQ16586 387 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 PAMR1Q6UXH9 720 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 FAM220AQ7Z4H9 259 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 LRRTM1Q86UE6 522 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 NAA40Q86UY6 237 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 SKA3Q8IX90 412 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 SLC22A24Q8N4F4 322 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF502Q8TBZ5 544 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 TBX15Q96SF7 602 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 ATF6BQ99941 703 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 SH3GL3Q99963 347 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 RSG1Q9BU20 258 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 TPK1Q9H3S4 243 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 OR52A1Q9UKL2 312 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 TPRP12270 2363 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 ACACBO00763 2458 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 USP24Q9UPU5 2620 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 A0A1W2PR80 420 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 CLDN25C9JDP6 229 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 TNFSF13O75888 250 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 ARL6IP5O75915 188 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 CGAP01215 116 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 IGHV3-9P01782 118 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF32P17041 273 aa3.31□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 RANBP1P43487 201 aa3.31□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 SLC35B1P78383 322 aa3.31□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 SFXN4Q6P4A7 337 aa3.31□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 CHMP1BQ7LBR1 199 aa3.31□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 ZNF676Q8N7Q3 588 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 GATAD1Q8WUU5 269 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 IL1F10Q8WWZ1 152 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 S100ZQ8WXG8 99 aa3.31□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 DUX3Q96PT4 197 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 OR5B12Q96R08 314 aa3.31□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 MOB1AQ9H8S9 216 aa3.31□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 B3GNT2Q9NY97 397 aa3.31□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 CCL21O00585 134 aa3.31□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 ENSAO43768 121 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 OXTP01178 125 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 CD3GP09693 182 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 CTXN2P0C2S0 81 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 OR9G9P0C7N8 305 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 PATE4P0C8F1 98 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 OCM2P0CE71 109 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 COX5BP10606 129 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 SELEP16581 610 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 RAB3BP20337 219 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 TIMP3P35625 211 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 EVX1P49640 407 aa3.31□□□□□ -1.88
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