RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527160.1

IRF7-209, Transcript of interferon regulatory factor 7, human

TSL 2

Gene IRF7, Length 617 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IRF7-209	ENST00000527160	GPR132	Q9UNW8	380 aa		18.24	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		18.23	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	RND3	P61587	244 aa		18.23	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		18.23	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		18.23	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		18.23	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		18.23	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		18.23	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	C5orf30	Q96GV9	206 aa		18.23	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	SMR3A	Q99954	134 aa		18.23	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		18.23	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	RNF150	Q9ULK6	438 aa		18.23	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	HIVEP2	P31629	2446 aa		18.23	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		18.22	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	GPR31	O00270	319 aa		18.22	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	HSD17B6	O14756	317 aa		18.22	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	PROP1	O75360	226 aa		18.22	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		18.22	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		18.22	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	ENKUR	Q8TC29	256 aa		18.22	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	PGAM2	P15259	253 aa		18.21	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	EPHA1	P21709	976 aa		18.21	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		18.21	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		18.21	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		18.21	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	OR8H3	Q8N146	312 aa		18.21	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	RPE	Q96AT9	228 aa		18.21	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		18.21	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	OCEL1	Q9H607	264 aa		18.21	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		18.21	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	VSIG4	Q9Y279	399 aa		18.21	■□□□□ 0.51
IRF7-209	ENST00000527160	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	TCRB	P04435	133 aa		18.2	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	S100G	P29377	79 aa		18.2	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	BAMBI	Q13145	260 aa		18.2	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	RGS21	Q2M5E4	152 aa		18.2	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		18.2	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		18.2	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		18.2	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		18.2	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		18.2	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	RIPPLY3	P57055	190 aa		18.19	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		18.19	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		18.19	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		18.19	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		18.18	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160		A0A1W2PPI3	338 aa		18.18	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160		A0A1W2PRD5	423 aa		18.18	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160		A0A1W2PRF3	423 aa		18.18	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160		A0A1W2PRM7	423 aa		18.18	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	RNF212B	A8MTL3	300 aa		18.18	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	THBS3	P49746	956 aa		18.18	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	ARHGDIB	P52566	201 aa		18.18	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	SCGB2A2	Q13296	93 aa		18.18	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	AANAT	Q16613	207 aa		18.18	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		18.18	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		18.18	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		18.18	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	NUDT15	Q9NV35	164 aa		18.18	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		18.17	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160		A0A0U1RQK1	487 aa		18.17	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	VGLL3	A8MV65	326 aa		18.17	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160		M0R1X1	148 aa		18.17	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	FBP1	P09467	338 aa		18.17	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	DYNLT3	P51808	116 aa		18.17	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	RAG2	P55895	527 aa		18.17	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	PIGP	P57054	158 aa		18.17	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	TAS2R31	P59538	309 aa		18.17	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		18.17	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	KCTD9	Q7L273	389 aa		18.17	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		18.17	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		18.17	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		18.17	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	DDB2	Q92466	427 aa		18.17	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	NABP2	Q9BQ15	211 aa		18.17	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		18.17	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	MTOR	P42345	2549 aa		18.17	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	B3GALNT1	O75752	331 aa		18.16	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	CT45A6	P0DMU7	189 aa		18.16	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	CT45A5	P0DMU8	189 aa		18.16	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	CT45A7	P0DMV0	189 aa		18.16	■□□□□ 0.5
IRF7-209	ENST00000527160	CATR1	Q13166	79 aa		18.16	■□□□□ 0.5

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