RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 OR4A5Q8NH83 315 aa4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM206AQ9NX38 181 aa4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 USE1Q9NZ43 259 aa4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM216Q9P0N5 145 aa4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 TTC28Q96AY4 2481 aa4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 FLT4P35916 1363 aa4.29□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 OR5H14A6NHG9 310 aa4.29□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 ARGFXA6NJG6 315 aa4.29□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 M0QYV0 167 aa4.29□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 AZIN1O14977 448 aa4.29□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 CD99P14209 185 aa4.29□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 GADD45AP24522 165 aa4.29□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 CD34P28906 385 aa4.29□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 MGAT3Q09327 533 aa4.29□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 IGFL1Q6UW32 110 aa4.29□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 OR5K1Q8NHB7 308 aa4.29□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 KCTD4Q8WVF5 259 aa4.29□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 CMBLQ96DG6 245 aa4.29□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 PYURFQ96I23 114 aa4.29□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 MBOAT7Q96N66 472 aa4.29□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC22A4Q9H015 551 aa4.29□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 LAMA3Q16787 3333 aa4.29□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 BRCA2P51587 3418 aa4.28□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 LAMB4A4D0S4 1761 aa4.28□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 THADAQ6YHU6 1953 aa4.28□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 ARL6IP5O75915 188 aa4.28□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 KLHL2O95198 593 aa4.28□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 PDYNP01213 254 aa4.28□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 LTAP01374 205 aa4.28□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 OCM2P0CE71 109 aa4.28□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 CTSEP14091 401 aa4.28□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 DOLPP1Q86YN1 238 aa4.28□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa4.28□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa4.28□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 KCTD7Q96MP8 289 aa4.28□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 B9D2Q9BPU9 175 aa4.28□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 MS4A6AQ9H2W1 248 aa4.28□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 MON2Q7Z3U7 1717 aa4.28□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 TONSLQ96HA7 1378 aa4.27□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 LTN1O94822 1766 aa4.27□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 DOT1LQ8TEK3 1739 aa4.27□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 C5P01031 1676 aa4.27□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 H3BQ85 93 aa4.27□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 STX10O60499 249 aa4.27□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 GPR75O95800 540 aa4.27□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 CFL1P23528 166 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 IFNGR2P38484 337 aa4.27□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 ZCWPW2Q504Y3 356 aa4.27□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC122Q5T0U0 273 aa4.27□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa4.27□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 CPNE9Q8IYJ1 553 aa4.27□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 SPPL2BQ8TCT7 592 aa4.27□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa4.27□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 ARL6Q9H0F7 186 aa4.27□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 OR2D2Q9H210 308 aa4.27□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF492Q9P255 531 aa4.27□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 GLS2Q9UI32 602 aa4.27□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 RGPD5Q99666 1765 aa4.27□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 A0A1W2PP64 1363 aa4.27□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 C4BP0C0L5 1744 aa4.26□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 BLVRAP53004 296 aa4.26□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 PDZD11Q5EBL8 140 aa4.26□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 EBLN2Q6P2I7 272 aa4.26□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 IGFL3Q6UXB1 125 aa4.26□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF561Q8N587 486 aa4.26□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF680Q8NEM1 530 aa4.26□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 OR1P1Q8NH06 330 aa4.26□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 GALMQ96C23 342 aa4.26□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 OR2V2Q96R30 315 aa4.26□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa4.25□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 F5H5T6 163 aa4.25□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 GABARAPL2P60520 117 aa4.25□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 ZFAND6Q6FIF0 208 aa4.25□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa4.25□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 YIPF7Q8N8F6 280 aa4.25□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 SPZ1Q9BXG8 430 aa4.25□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 MROQ9BYG7 248 aa4.25□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 UBQLN4Q9NRR5 601 aa4.25□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 SNX10Q9Y5X0 201 aa4.25□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 MYO3BQ8WXR4 1341 aa4.24□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 A0A0B4J2C4 111 aa4.24□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 A6NED7 52 aa4.24□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 B4DEV8 164 aa4.24□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 H3BMM0 161 aa4.24□□□□□ -1.73
PGGT1B-205ENST00000514178 KRT7P08729 469 aa4.24□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms