RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513678.5

MATR3-222, Transcript of matrin 3, human

TSL 2

Gene MATR3, Length 444 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-222	ENST00000513678	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		13.13	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	SPART	Q8N0X7	666 aa		13.13	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		13.13	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	FCGR1B	Q92637	280 aa		13.13	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	RAB3C	Q96E17	227 aa		13.13	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	KIAA1456	Q9P272	454 aa		13.13	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	MFNG	O00587	321 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	HSPA12A	O43301	675 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	PROP1	O75360	226 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	IGLV1-40	P01703	118 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	CNTFR	P26992	372 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	OR10A3	P58181	314 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	PLA2G7	Q13093	441 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	13.12	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	LIN54	Q6MZP7	749 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	RRH	O14718	337 aa		13.11	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	CD3G	P09693	182 aa		13.11	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	GADD45A	P24522	165 aa		13.11	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	RUNX1	Q01196	453 aa		13.11	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	ARL6IP1	Q15041	203 aa		13.11	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		13.11	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		13.11	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		13.11	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		13.11	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678		Q6ZS49	121 aa		13.11	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		13.11	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	B9D2	Q9BPU9	175 aa		13.11	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	CENPO	Q9BU64	300 aa		13.11	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	13.11	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	GAB2	Q9UQC2	676 aa		13.11	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		13.1	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	ATP6V0E1	O15342	81 aa		13.1	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	FABP7	O15540	132 aa		13.1	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	FCGR3A	P08637	254 aa		13.1	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		13.1	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	C22orf42	Q6IC83	251 aa		13.1	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		13.1	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		13.1	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		13.1	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		13.1	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	RDH8	Q9NYR8	311 aa		13.1	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	ZNF221	Q9UK13	617 aa		13.1	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		13.09	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		13.09	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	NOTO	A8MTQ0	251 aa		13.09	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	SPDEF	O95238	335 aa		13.09	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	DGCR2	P98153	550 aa		13.09	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	TPRA1	Q86W33	373 aa		13.09	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	PARP11	Q9NR21	331 aa		13.09	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678	STUB1	Q9UNE7	303 aa		13.09	□□□□□ -0.31
MATR3-222	ENST00000513678		G3V318	75 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678	RAMP3	O60896	148 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678	TFAP2A	P05549	437 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678	PSMB9	P28065	219 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678	RAB25	P57735	213 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678	CX3CL1	P78423	397 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678	NDP	Q00604	133 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678	ZNF773	Q6PK81	442 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678	PDPN	Q86YL7	162 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678	KLK15	Q9H2R5	256 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678	FBXL15	Q9H469	300 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678		H7C2Y5	167 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678		I3L521	148 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678	GNB3	P16520	340 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678	DTYMK	P23919	212 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678	CD69	Q07108	199 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678	TMEM65	Q6PI78	240 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678	ZNF383	Q8NA42	475 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678	GNB4	Q9HAV0	340 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678	RNF150	Q9ULK6	438 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678	VSIG4	Q9Y279	399 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678	SCGN	O76038	276 aa		13.06	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678	APOA2	P02652	100 aa		13.06	□□□□□ -0.32
MATR3-222	ENST00000513678	IGKV1-16	P04430	117 aa		13.06	□□□□□ -0.32

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