RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510193.1

SH3BP2-216, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 407 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-216ENST00000510193 OR5H14A6NHG9 310 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 FCN1O00602 326 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 RRHO14718 337 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 OR5H8P0DN80 308 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 RAB25P57735 213 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 GNB1P62873 340 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 NEDD8Q15843 81 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 HES5Q5TA89 166 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 LIN54Q6MZP7 749 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 NR2C2APQ86WQ0 139 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 C5orf30Q96GV9 206 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 SCOCQ9UIL1 159 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 GAB2Q9UQC2 676 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 V9GY05 133 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 SMIM30A4D0T7 59 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 ZBTB25P24278 435 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 CEACAM6P40199 344 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 CX3CL1P78423 397 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 RUNX1Q01196 453 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 KCTD21Q4G0X4 260 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 C22orf42Q6IC83 251 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF383Q8NA42 475 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 OR11H1Q8NG94 326 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 OR5M8Q8NGP6 311 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 FCGR1BQ92637 280 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 DPF1Q92782 380 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 UBE2E2Q96LR5 201 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 TOLLIPQ9H0E2 274 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 A0A0B4J203 849 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 RAB27BO00194 218 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 MFNGO00587 321 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 IGKV1-16P04430 117 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 CD3GP09693 182 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 RAB9AP51151 201 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 DGCR2P98153 550 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 DEFB121Q5J5C9 76 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 OR56B1Q8NGI3 324 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 CASTOR1Q8WTX7 329 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 EDARADDQ8WWZ3 215 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 OR5B12Q96R08 314 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 B9D2Q9BPU9 175 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 CABLES2Q9BTV7 478 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 OR51E2Q9H255 320 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 TPSG1Q9NRR2 321 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 RDH8Q9NYR8 311 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 KIAA1456Q9P272 454 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 RNF150Q9ULK6 438 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 MGAT4AQ9UM21 535 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 WASHC3Q9Y3C0 194 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 COL7A1Q02388 2944 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 IFITM5A6NNB3 132 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 TRDCB7Z8K6 153 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 RBBP9O75884 186 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 FCGR3AP08637 254 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 PSG5Q15238 335 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 ECSCRQ19T08 205 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 IGSF11Q5DX21 431 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 C9orf66Q5T8R8 295 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 PRR25Q96S07 402 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 GHITMQ9H3K2 345 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 RAB22AQ9UL26 194 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 STUB1Q9UNE7 303 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 VSIG4Q9Y279 399 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-216ENST00000510193 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-216ENST00000510193 A0A1W2PN81 502 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-216ENST00000510193 SEC14L6B5MCN3 397 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-216ENST00000510193 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-216ENST00000510193 FABP7O15540 132 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-216ENST00000510193 HSPA12AO43301 675 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-216ENST00000510193 IGLV2-23P01705 113 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-216ENST00000510193 GNB3P16520 340 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-216ENST00000510193 MYL9P24844 172 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-216ENST00000510193 MC5RP33032 325 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-216ENST00000510193 CHRNA7P36544 502 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-216ENST00000510193 VAX1Q5SQQ9 334 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-216ENST00000510193 TSPAN14Q8NG11 270 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-216ENST00000510193 OR4A4PQ8NGN8 299 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-216ENST00000510193 OR1N2Q8NGR9 330 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-216ENST00000510193 OR10R2Q8NGX6 335 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-216ENST00000510193 MAFIPQ8WZ33 124 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-216ENST00000510193 RAB3CQ96E17 227 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-216ENST00000510193 RNF5Q99942 180 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-216ENST00000510193 RNF167Q9H6Y7 350 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-216ENST00000510193 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-216ENST00000510193 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-216ENST00000510193 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-216ENST00000510193 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms