RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505399.2

FBXO38-209, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 5

Gene FBXO38, Length 843 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-209	ENST00000505399	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	ZNF596	Q8TC21	504 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	RNF141	Q8WVD5	230 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	TNFRSF14	Q92956	283 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	COQ2	Q96H96	371 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	GAFA1	Q96PS6	74 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	TP53RK	Q96S44	253 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	CEP250	Q9BV73	2442 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399		A6NNC1	897 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	NUDT19	A8MXV4	375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	DVL1	O14640	695 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	TXNL1	O43396	289 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	FCGR3B	O75015	233 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	ACTL6B	O94805	426 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	SPDEF	O95238	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	PLAU	P00749	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	KRAS	P01116	189 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	SSTR5	P35346	364 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	HTR2B	P41595	481 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	PDLIM4	P50479	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	RAB13	P51153	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	EFNA4	P52798	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	BAX	Q07812	192 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	HERPUD1	Q15011	391 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	ATP6V1F	Q16864	119 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	MSMP	Q1L6U9	139 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	FAM201A	Q5SY85	155 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	BAP18	Q8IXM2	172 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	LILRB2	Q8N423	598 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	FGFRL1	Q8N441	504 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	ZNF709	Q8N972	641 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	OR9G1	Q8NH87	305 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	UBALD1	Q8TB05	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	OR10C1	Q96KK4	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	AQP10	Q96PS8	301 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	COL6A3	P12111	3177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	C15orf65	H3BRN8	121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	EREG	O14944	169 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	SHOX	O15266	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	CYB5B	O43169	146 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	SYNGR2	O43760	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	SSSCA1	O60232	199 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	RBP4	P02753	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	PRH1	P02810	166 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	FGF2	P09038	288 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	COL8A2	P25067	703 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	GNG10	P50151	68 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	RAB5C	P51148	216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	F2RL1	P55085	397 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	DSCR9	P59020	149 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	TAS2R30	P59541	319 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	TLE4	Q04727	773 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	RAB31	Q13636	194 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	MIDN	Q504T8	468 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-209	ENST00000505399	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 141.3 ms