RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	TAS2R45	P59539	299 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR1L3	Q8NH93	324 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	SARAF	Q96BY9	339 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A087X0K7	114 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1W2PS18	150 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549		H3BRM9	83 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	CHEK1	O14757	476 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	LMX1B	O60663	402 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM87A	P0C7U9	286 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	FKBP1B	P68106	108 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	PP6455	Q8WZ26	134 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		7.03	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		7.03	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		7.03	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	HELT	A6NFD8	242 aa		7.03	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	EFEMP2	O95967	443 aa		7.03	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR5AL1	P0C617	328 aa		7.03	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		7.03	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		7.03	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		7.03	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		7.03	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		7.03	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	RLF	Q13129	1914 aa		7.03	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	CRYBB3	P26998	211 aa		7.03	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		7.03	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		7.03	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		7.03	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	VCX2	Q9H322	139 aa		7.03	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		7.03	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	CAMP	P49913	170 aa		7.03	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		7.03	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRR22	Q8IZ63	422 aa		7.03	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR2M3	Q8NG83	312 aa		7.03	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		7.03	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR10D3	Q8NH80	312 aa		7.03	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPTSSA	Q969W0	71 aa		7.03	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		7.03	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		7.02	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1B0GWB2	263 aa		7.02	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	FCER1G	P30273	86 aa		7.02	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	G6PC	P35575	357 aa		7.02	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	CTRL	P40313	264 aa		7.02	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	CSN1S1	P47710	185 aa		7.02	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	TCTA	P57738	103 aa		7.02	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		7.02	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		7.02	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR4A16	Q8NH70	328 aa		7.02	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		7.02	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.28
CRNKL1-205	ENST00000496549	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	LYPD3	O95274	346 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	PF4V1	P10720	104 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	SRF	P11831	508 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	TIMP3	P35625	211 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	MFAP2	P55001	183 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	EDDM3B	P56851	147 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	TCF24	Q7RTU0	167 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	LYRM4	Q9HD34	91 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	SHISA7	A6NL88	538 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR11H12	B2RN74	326 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	RER1	O15258	196 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	CT45A6	P0DMU7	189 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	CT45A5	P0DMU8	189 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	CT45A7	P0DMV0	189 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	GCSH	P23434	173 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF141	Q15928	474 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	RTL8B	Q17RB0	113 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR11H1	Q8NG94	326 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR11H2	Q8NH07	326 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	STRADB	Q9C0K7	418 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		7.02	□□□□□ -1.29

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms