RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466185.1

PRPF4B-204, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF4B, Length 1,297 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-204ENST00000466185 FOXC2Q99958 501 aa4.66□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 MICU1Q9BPX6 476 aa4.66□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 TLNRD1Q9H1K6 362 aa4.66□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 TAS2R4Q9NYW5 299 aa4.66□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 CTSZQ9UBR2 303 aa4.66□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 SLC7A11Q9UPY5 501 aa4.66□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 CACNA1DQ01668 2161 aa4.65□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 VPS13CQ709C8 3753 aa4.65□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 XKRY2A2RUG3 117 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 LRP5LA4QPB2 252 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 EPM2AB3EWF7 344 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 LYNX1G3V0Z9 82 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 NDUFS8O00217 210 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 GABRPO00591 440 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 CDIPTO14735 213 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 PIN1P1O15428 100 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 SULT1B1O43704 296 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 RP2O75695 350 aa4.65□□□□□ -1.67
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PRPF4B-204ENST00000466185 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 CSF3P09919 207 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 LYNX1P0DP58 116 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 CD36P16671 472 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 RAB3AP20336 220 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 COL8A2P25067 703 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 PMELP40967 661 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 HAAOP46952 286 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 ALDH3B2P48448 385 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 ATP1B3P54709 279 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 PPP3R1P63098 170 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 CD300CQ08708 224 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 MPPED2Q15777 294 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 DMRTC1Q5HYR2 192 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 FAM27D1Q5T7N8 215 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 FAM71F2Q6NXP2 309 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 REG3GQ6UW15 175 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 C11orf53Q8IXP5 236 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 LINC01561Q8N1V8 128 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 BPIFB2Q8N4F0 458 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF525Q8N782 197 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 STXBP6Q8NFX7 210 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 OR51A2Q8NGJ7 313 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 OR4D5Q8NGN0 318 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 OR13F1Q8NGS4 319 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 RFESDQ8TAC1 157 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 AQP3Q92482 292 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 YIPF6Q96EC8 236 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 BORCS8Q96FH0 119 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
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PRPF4B-204ENST00000466185 NEK6Q9HC98 313 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 TMEM106BQ9NUM4 274 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 UFSP2Q9NUQ7 469 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 CKLFQ9UBR5 152 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 RPH3ALQ9UNE2 315 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 RNF24Q9Y225 148 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 CACNG2Q9Y698 323 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 USF3Q68DE3 2245 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 TEX15Q9BXT5 2789 aa4.65□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 DSCAMO60469 2012 aa4.64□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa4.64□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 CYSRT1A8MQ03 144 aa4.64□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 SRRM5B3KS81 715 aa4.64□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 CLDN25C9JDP6 229 aa4.64□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 J3QT63 122 aa4.64□□□□□ -1.67
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PRPF4B-204ENST00000466185 MAS1P04201 325 aa4.64□□□□□ -1.67
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PRPF4B-204ENST00000466185 SRMP19623 302 aa4.64□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 GADD45AP24522 165 aa4.64□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 CFHR2P36980 270 aa4.64□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 RBP2P50120 134 aa4.64□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 TMEM33P57088 247 aa4.64□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 KISS1Q15726 138 aa4.64□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 CLEC12BQ2HXU8 276 aa4.64□□□□□ -1.67
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PRPF4B-204ENST00000466185 HSD17B12Q53GQ0 312 aa4.64□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 C22orf42Q6IC83 251 aa4.64□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 CLEC2AQ6UVW9 174 aa4.64□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 WDR82Q6UXN9 313 aa4.64□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF826PQ6ZT77 177 aa4.64□□□□□ -1.67
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PRPF4B-204ENST00000466185 CALHM1Q8IU99 346 aa4.64□□□□□ -1.67
PRPF4B-204ENST00000466185 OR5D13Q8NGL4 314 aa4.64□□□□□ -1.67
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