RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, human

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP4-208	ENST00000462602	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	RND3	P61587	244 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	7.62	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	SCGB2A2	Q13296	93 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	7.62	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	PLET1	Q6UQ28	207 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	OR8H3	Q8N146	312 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	DRAM1	Q8N682	238 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	VPS13C	Q709C8	3753 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602		M0R1X1	148 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	IGLV2-14	P01704	120 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	THBS3	P49746	956 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	PIGP	P57054	158 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	TAS2R31	P59538	309 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	BAMBI	Q13145	260 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	CATR1	Q13166	79 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	SSX2	Q16385	188 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	SMR3A	Q99954	134 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	OCEL1	Q9H607	264 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	VSIG4	Q9Y279	399 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	HIVEP2	P31629	2446 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	MPPED1	O15442	326 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	PROP1	O75360	226 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	B3GALNT1	O75752	331 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	FBP1	P09467	338 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	PI3	P19957	117 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	MC5R	P33032	325 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	RAG2	P55895	527 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	CBX3	Q13185	183 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	TRIM16L	Q309B1	348 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	KCTD9	Q7L273	389 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	BEX2	Q9BXY8	128 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	NUDT15	Q9NV35	164 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZAN	Q9Y493	2812 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	AKAP9	Q99996	3911 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602		A0A0U1RQK1	487 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	TNFSF12	O43508	249 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	PEX14	O75381	377 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	APOA2	P02652	100 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	CT45A6	P0DMU7	189 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	CT45A5	P0DMU8	189 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	CT45A7	P0DMV0	189 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	RRAS	P10301	218 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	ANXA3	P12429	323 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	AKR1C4	P17516	323 aa		7.59	□□□□□ -1.19

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