RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-211	ENST00000429595	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	ZNF878	C9JN71	531 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	SMLR1	H3BR10	107 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595		H3BUX3	64 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	IFNL4	K9M1U5	179 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	IGHG1	P01857	330 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	TTR	P02766	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	CD3D	P04234	171 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	SERPINA5	P05154	406 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	FCER2	P06734	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	ACSM4	P0C7M7	580 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	PGA4	P0DJD7	388 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	PGA3	P0DJD8	388 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	ZNF43	P17038	809 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	ZP3	P21754	424 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	ZBTB25	P24278	435 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	AMT	P48728	403 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	CX3CR1	P49238	355 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	H2BFS	P57053	126 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	ERVS71-1	P61550	626 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	ECH1	Q13011	328 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	AANAT	Q16613	207 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	ZNF774	Q6NX45	483 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	MOB3C	Q70IA8	216 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	NAA40	Q86UY6	237 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	OR8H3	Q8N146	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	BEST4	Q8NFU0	473 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	TMEM54	Q969K7	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	TECTB	Q96PL2	329 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	OR5H14	A6NHG9	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	LRRC30	A6NM36	301 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	C11orf98	E9PRG8	122 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	TMEM178B	H3BS89	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595		H7C1C5	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	SYT7	O43581	403 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	CD55	P08174	381 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	NMB	P08949	121 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	CCL2	P13500	99 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	CCNO	P22674	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	NPY4R	P50391	375 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	ARF6	P62330	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	LCN6	P62502	163 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	MADCAM1	Q13477	382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	CDNF	Q49AH0	187 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	UQCC3	Q6UW78	93 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	ASCL4	Q6XD76	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	LYG2	Q86SG7	212 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	HOGA1	Q86XE5	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	GJC3	Q8NFK1	279 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	TERB2	Q8NHR7	220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	STOML3	Q8TAV4	291 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	SUN5	Q8TC36	379 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	PP6455	Q8WZ26	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	SSX3	Q99909	188 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-211	ENST00000429595	TM2D1	Q9BX74	207 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms