RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 RAB1CQ92928 201 aa12.61□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 RAB9BQ9NP90 201 aa12.61□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 CHD6Q8TD26 2715 aa12.6□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 MSGN1A6NI15 193 aa12.6□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 K7EPK0 472 aa12.6□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 FSTL3O95633 263 aa12.6□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 LYL1P12980 280 aa12.6□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 DUTP33316 252 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 HEPN1Q6WQI6 88 aa12.6□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa12.6□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 SPAG16Q8N0X2 631 aa12.6□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa12.6□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 C11orf42Q8N5U0 333 aa12.6□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 IL22RA2Q969J5 263 aa12.6□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa12.6□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 CHODLQ9H9P2 273 aa12.6□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 FAM208BQ5VWN6 2430 aa12.6□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 MED13LQ71F56 2210 aa12.6□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 RNF212BA8MTL3 300 aa12.59□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 M0R1X1 148 aa12.59□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 TEX261Q6UWH6 196 aa12.59□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 LYG1Q8N1E2 194 aa12.59□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF251Q9BRH9 671 aa12.59□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 U3KQ87 197 aa12.59□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa12.59□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa12.59□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 A1L4Q6 167 aa12.59□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 ITGB1BP1O14713 200 aa12.59□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 DEDDO75618 318 aa12.59□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 B3GALNT1O75752 331 aa12.59□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM33P57088 247 aa12.59□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 MSMO1Q15800 293 aa12.59□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM155Q4W5P6 130 aa12.59□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF66Q6ZN08 573 aa12.59□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 KCNRGQ8N5I3 272 aa12.59□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 TIMD4Q96H15 378 aa12.59□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 SPOCK3Q9BQ16 436 aa12.59□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 MAGT1Q9H0U3 335 aa12.59□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 MIOXQ9UGB7 285 aa12.59□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 OVOL3O00110 214 aa12.58□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 S1PR2O95136 353 aa12.58□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 KRASP01116 189 aa12.58□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 G6PCP35575 357 aa12.58□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 EFNA4P52798 201 aa12.58□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 CATR1Q13166 79 aa12.58□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 CLEC9AQ6UXN8 241 aa12.58□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 OR8B3Q8NGG8 313 aa12.58□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 OR8B2Q96RD0 313 aa12.58□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 SPG11Q96JI7 2443 aa12.57□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 A0A0D9SG52 128 aa12.57□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 CLEC18AA5D8T8 446 aa12.57□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 OR2F2O95006 317 aa12.57□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 RLN2P04090 185 aa12.57□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 RAB7AP51149 207 aa12.57□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP12.57□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 OR2F1Q13607 317 aa12.57□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 CLEC18CQ8NCF0 446 aa12.57□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF680Q8NEM1 530 aa12.57□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 DMBX1Q8NFW5 382 aa12.57□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 LPAR3Q9UBY5 353 aa12.57□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 LRRK2Q5S007 2527 aa12.57□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 ST8SIA3O43173 380 aa12.57□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 FCGR3BO75015 233 aa12.57□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 AKR1C2P52895 323 aa12.57□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 TLE4Q04727 773 aa12.57□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF525Q8N782 197 aa12.57□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 OR10A7Q8NGE5 316 aa12.57□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 CACNG5Q9UF02 275 aa12.57□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 GAB2Q9UQC2 676 aa12.57□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 SVEP1Q4LDE5 3571 aa12.56□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa12.56□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 RAB29O14966 203 aa12.56□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 PITX3O75364 302 aa12.56□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 SNAPC5O75971 98 aa12.56□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 PPIAL4GP0DN37 164 aa12.56□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 IGHV1-8P0DP01 117 aa12.56□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 HKR1P10072 659 aa12.56□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 ID3Q02535 119 aa12.56□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF345Q14585 488 aa12.56□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa12.56□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 IGFBPL1Q8WX77 278 aa12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms