RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM19A2Q8N3H0 131 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 SUMF1Q8NBK3 374 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 FREM2Q5SZK8 3169 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 CLDN1O95832 211 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 GYPAP02724 150 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 C1orf53Q5VUE5 145 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 UFSP1Q6NVU6 142 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF841Q6ZN19 808 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 PERPQ96FX8 193 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 EMC6Q9BV81 110 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 CFHR5Q9BXR6 569 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 VSIRQ9H7M9 311 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 MED29Q9NX70 200 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 PLEK2Q9NYT0 353 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A1W2PP11 408 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 C7orf71A4D174 169 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 NTF3P20783 257 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 VAX1Q5SQQ9 334 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 OR10P1Q8NGE3 313 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 TAAR6Q96RI8 345 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 P2RX4Q99571 388 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 RPRMQ9NS64 109 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 HHLA2Q9UM44 414 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A0G2JMM0 328 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A1W2PPB8 328 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 KIR3DP1A8MWS1 328 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 HS3ST1O14792 307 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 CELA3AP09093 270 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 MYF5P13349 255 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 DYNLT3P51808 116 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 NRN1LQ496H8 165 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRR31Q5SQ13 230 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 SGMS2Q8NHU3 365 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 POLR1DQ9Y2S0 133 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 EPOPA6NHQ4 379 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 AGFG2O95081 481 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 PNMTP11086 282 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF17P17021 662 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 FSTP19883 344 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 OTX2P32243 289 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 ARL3P36405 182 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q56UQ5 140 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 TSPO2Q5TGU0 170 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 LHFPL1Q86WI0 220 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMUB1Q9BVT8 246 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRSS37A4D1T9 235 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF732B4DXR9 585 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 CD5LO43866 347 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF737O75373 536 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 TNFP01375 233 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 PLA2G5P39877 138 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 AP1S3Q96PC3 154 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 BANF2Q9H503 90 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa9.21□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa9.21□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 MEGF11A6BM72 1044 aa9.21□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 BGLAPP02818 100 aa9.21□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 EN2P19622 333 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 IL12BP29460 328 aa9.21□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 ARFRP1Q13795 201 aa9.21□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 FNDC7Q5VTL7 733 aa9.21□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 CT55Q8WUE5 264 aa9.21□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 RCHY1Q96PM5 261 aa9.21□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa9.21□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 CLEC7AQ9BXN2 247 aa9.21□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 PECRQ9BY49 303 aa9.21□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 GNB4Q9HAV0 340 aa9.21□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 GP6Q9HCN6 339 aa9.21□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 SLC7A10Q9NS82 523 aa9.21□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa9.21□□□□□ -0.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 H3BML4 177 aa9.21□□□□□ -0.94
APOBEC3C-201ENST00000361441 J3QR06 171 aa9.21□□□□□ -0.94
APOBEC3C-201ENST00000361441 PITX3O75364 302 aa9.21□□□□□ -0.94
APOBEC3C-201ENST00000361441 CA7P43166 264 aa9.21□□□□□ -0.94
APOBEC3C-201ENST00000361441 FUT7Q11130 342 aa9.21□□□□□ -0.94
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF726P1Q15940 193 aa9.21□□□□□ -0.94
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGFBP7Q16270 282 aa9.21□□□□□ -0.94
APOBEC3C-201ENST00000361441 STPG3Q8N7X2 389 aa9.21□□□□□ -0.94
APOBEC3C-201ENST00000361441 SLC25A40Q8TBP6 338 aa9.21□□□□□ -0.94
APOBEC3C-201ENST00000361441 BORCS7Q96B45 105 aa9.21□□□□□ -0.94
APOBEC3C-201ENST00000361441 C8orf44Q96CB5 159 aa9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms