RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 BTF3L4Q96K17 158 aa14.24□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 RNF114Q9Y508 228 aa14.24□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 NKX6-3A6NJ46 265 aa14.24□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 C11orf94C9JXX5 98 aa14.24□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 BMP5P22003 454 aa14.24□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 PLCXD3Q63HM9 321 aa14.24□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 OR10G9Q8NGN4 311 aa14.24□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 OR10G7Q8NGN6 311 aa14.24□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 OR1L6Q8NGR2 347 aa14.24□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 SAMD10Q9BYL1 202 aa14.24□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 CRYAAP02489 173 aa14.23□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 CBLN1P23435 193 aa14.23□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 FOXL1Q12952 345 aa14.23□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 IL11RAQ14626 422 aa14.23□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa14.23□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 IMMP1LQ96LU5 166 aa14.23□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 DERL1Q9BUN8 251 aa14.23□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 F2Z2F3 143 aa14.23□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 IGKV1-39P01597 117 aa14.23□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 IGKV1D-39P04432 117 aa14.23□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 CD99P14209 185 aa14.23□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 CDKN1BP46527 198 aa14.23□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 C10orf128Q5T292 105 aa14.23□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 TMEM42Q69YG0 159 aa14.23□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 Q6ZS49 121 aa14.23□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 Q6ZVH6 145 aa14.23□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 ZNF611Q8N823 705 aa14.23□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 ZNF114Q8NC26 417 aa14.23□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 OR4B1Q8NGF8 309 aa14.23□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 PROK2Q9HC23 129 aa14.23□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 DHHO43323 396 aa14.22□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 CRISP2P16562 243 aa14.22□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 CRYGSP22914 178 aa14.22□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 LHX2P50458 406 aa14.22□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 WDR54Q9H977 334 aa14.22□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa14.22□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 OR6C6A6NF89 314 aa14.22□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 NAPSAO96009 420 aa14.22□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 TRIM61Q5EBN2 209 aa14.22□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 ORAOV1Q8WV07 137 aa14.22□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 PIGCQ92535 297 aa14.22□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 TUBG2Q9NRH3 451 aa14.22□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 FBXL7Q9UJT9 491 aa14.22□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 NCOR1O75376 2440 aa14.22□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 TNFSF11O14788 317 aa14.22□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 ESDP10768 282 aa14.22□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 SSR4P51571 173 aa14.22□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 FUT6P51993 359 aa14.22□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 KRTDAPP60985 99 aa14.22□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 AARDQ4LEZ3 155 aa14.22□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 SLC45A2Q9UMX9 530 aa14.22□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 TIMM9Q9Y5J7 89 aa14.22□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 NPIPA2E9PIF3 369 aa14.21□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 NPIPA3F8WFD2 350 aa14.21□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP14.21□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 ZIC3O60481 467 aa14.21□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 S100GP29377 79 aa14.21□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 GNB1P62873 340 aa14.21□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 SPATA45Q537H7 98 aa14.21□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 FFAR4Q5NUL3 377 aa14.21□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 BAGE3Q86Y29 109 aa14.21□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 BAGE2Q86Y30 109 aa14.21□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 GPR179Q6PRD1 2367 aa14.21□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 A0A0G2JMM0 328 aa14.21□□□□□ -0.14
GDE1-201ENST00000353258 A0A1W2PPB8 328 aa14.21□□□□□ -0.14
GDE1-201ENST00000353258 A0A1W2PRS3 328 aa14.21□□□□□ -0.14
GDE1-201ENST00000353258 KIR3DP1A8MWS1 328 aa14.21□□□□□ -0.14
GDE1-201ENST00000353258 IGKV1-5P01602 117 aa14.21□□□□□ -0.14
GDE1-201ENST00000353258 LIFP15018 202 aa14.21□□□□□ -0.14
GDE1-201ENST00000353258 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.14
GDE1-201ENST00000353258 TXN2Q99757 166 aa14.21□□□□□ -0.14
GDE1-201ENST00000353258 ZNF407Q9C0G0 2248 aa14.21□□□□□ -0.14
GDE1-201ENST00000353258 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa14.21□□□□□ -0.14
GDE1-201ENST00000353258 URB1O60287 2271 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
GDE1-201ENST00000353258 CTRLP40313 264 aa14.2□□□□□ -0.14
GDE1-201ENST00000353258 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa14.2□□□□□ -0.14
GDE1-201ENST00000353258 LYG1Q8N1E2 194 aa14.2□□□□□ -0.14
GDE1-201ENST00000353258 SFRP2Q96HF1 295 aa14.2□□□□□ -0.14
GDE1-201ENST00000353258 KNTC1P50748 2209 aa14.2□□□□□ -0.14
GDE1-201ENST00000353258 TRAV34A0A0B4J273 112 aa14.2□□□□□ -0.14
GDE1-201ENST00000353258 A0A0J9YW62 118 aa14.2□□□□□ -0.14
GDE1-201ENST00000353258 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa14.2□□□□□ -0.14
GDE1-201ENST00000353258 NDUFB4O95168 129 aa14.2□□□□□ -0.14
GDE1-201ENST00000353258 KIR2DS4P43632 304 aa14.2□□□□□ -0.14
GDE1-201ENST00000353258 UBE2G2P60604 165 aa14.2□□□□□ -0.14
GDE1-201ENST00000353258 KIR2DS1Q14954 304 aa14.2□□□□□ -0.14
GDE1-201ENST00000353258 RNF151Q2KHN1 245 aa14.2□□□□□ -0.14
GDE1-201ENST00000353258 Q6ZN92 141 aa14.2□□□□□ -0.14
GDE1-201ENST00000353258 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
GDE1-201ENST00000353258 UBALD2Q8IYN6 164 aa14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms