RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Xlr4bQ9JJQ7 215 aa9.05□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spaca5A2AE20 160 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr231E9Q0M4 307 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr568E9Q554 313 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm21732J3QM79 361 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cited2O35740 269 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MgmtP26187 211 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PjvkQ0ZLH2 352 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm9733Q1AN91 178 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spem1Q5F289 310 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Orm1Q60590 207 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ArhgdibQ61599 200 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tfap2eQ6VUP9 442 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tm7sf2Q71KT5 418 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SelenoiQ80TA1 398 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam76bQ80XP8 339 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bhlhe23Q8BGW3 223 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mob3cQ8BJG4 216 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Commd2Q8BXC6 199 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pitpnc1Q8K4R4 332 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 GaleQ8R059 347 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r21Q8R2C6 297 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Alg12Q8VDB2 486 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1361Q8VFH0 317 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Itfg2Q91WI7 443 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vgll1Q99NC0 307 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zdhhc13Q9CWU2 622 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dcun1d5Q9CXV9 237 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem160Q9D938 188 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q9DAD0 168 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Abhd5Q9DBL9 351 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nek6Q9ES70 313 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Uts2Q9QZQ3 123 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpr34Q9R1K6 375 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SpdefQ9WTP3 325 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ramp2Q9WUP0 189 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Loxl3Q9Z175 754 aa9.04□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1107A2AVB8 312 aa9.03□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm11127A7VMS2 374 aa9.03□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm4884E9PVP9 694 aa9.03□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r174E9PYW5 313 aa9.03□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr68E9PYY2 315 aa9.03□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 4930579F01RikE9Q3L6 325 aa9.03□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r173E9Q8V7 313 aa9.03□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ly86O88188 162 aa9.03□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Krt1P04104 637 aa9.03□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Reg1P43137 165 aa9.03□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 UbdP63072 162 aa9.03□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Foxf1Q61080 378 aa9.03□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klk8Q61955 260 aa9.03□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 OmgQ63912 440 aa9.03□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp729bQ80VN4 1045 aa9.03□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ssxb2Q8C5Z3 165 aa9.03□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kctd20Q8CDD8 419 aa9.03□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nkiras1Q8CEC5 192 aa9.03□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cml2Q8CHQ9 238 aa9.03□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fn3krpQ8K274 309 aa9.03□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fcrl1Q8R4Y0 343 aa9.03□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zmynd11Q8R5C8 602 aa9.03□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1451Q8VFX5 310 aa9.03□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nuf2Q99P69 463 aa9.03□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mrpl15Q9CPR5 295 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rtl8bQ9D1F0 113 aa9.03□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nos1apQ9D3A8 503 aa9.03□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Actl11Q9D5V1 1207 aa9.03□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prr30Q9D9B7 401 aa9.03□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr943Q9EQ92 314 aa9.03□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fbp1Q9QXD6 338 aa9.03□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Notch1Q01705 2531 aa9.02□□□□□ -0.96
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr911-ps1A0A140T8K0 311 aa9.02□□□□□ -0.97
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr172E9Q8F6 309 aa9.02□□□□□ -0.97
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r82G3UWA2 865 aa9.02□□□□□ -0.97
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm21761J3QK00 171 aa9.02□□□□□ -0.97
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm20767O70517 169 aa9.02□□□□□ -0.97
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ifna4P07351 186 aa9.02□□□□□ -0.97
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem14aP56983 99 aa9.02□□□□□ -0.97
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rab3aP63011 220 aa9.02□□□□□ -0.97
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pitx2P97474 317 aa9.02□□□□□ -0.97
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1340Q3KPC7 315 aa9.02□□□□□ -0.97
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lhfpl4Q5U4E0 247 aa9.02□□□□□ -0.97
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tas2r117Q7M715 330 aa9.02□□□□□ -0.97
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc32Q8BS39 179 aa9.02□□□□□ -0.97
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpr4Q8BUD0 365 aa9.02□□□□□ -0.97
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zmat4Q8BZ94 229 aa9.02□□□□□ -0.97
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Depp1Q8K2F3 205 aa9.02□□□□□ -0.97
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1462Q8VFW3 307 aa9.02□□□□□ -0.97
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc35a5Q921R7 437 aa9.02□□□□□ -0.97
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lmo1Q924W9 156 aa9.02□□□□□ -0.97
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Thumpd1Q99J36 350 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rhox2aQ9D4Y3 191 aa9.02□□□□□ -0.97
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prss37Q9DAA4 237 aa9.02□□□□□ -0.97
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr945Q9EQB5 319 aa9.02□□□□□ -0.97
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kcnip1Q9JJ57 227 aa9.02□□□□□ -0.97
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fbln5Q9WVH9 448 aa9.02□□□□□ -0.97
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ighv4-1A0A075B5R5 116 aa9.01□□□□□ -0.97
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm28778A0A087WSK7 233 aa9.01□□□□□ -0.97
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr455A0A0B4J1M2 317 aa9.01□□□□□ -0.97
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lnp1A0A1B0GSK3 178 aa9.01□□□□□ -0.97
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1234A2AVK5 314 aa9.01□□□□□ -0.97
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr727A2RTN7 324 aa9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42.7 ms