RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612288.1

CYFIP1-205, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CYFIP1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-205ENST00000612288 GHITMQ9H3K2 345 aa8.31□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 GNB4Q9HAV0 340 aa8.31□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 SLC23A1Q9UHI7 598 aa8.31□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 SCOCQ9UIL1 159 aa8.31□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 MGAT4AQ9UM21 535 aa8.31□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 WSB1Q9Y6I7 421 aa8.31□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa8.3□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 TMEM14DPA8MWL7 114 aa8.3□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 ITGB1BP1O14713 200 aa8.3□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 ST8SIA5O15466 376 aa8.3□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 UCHL1P09936 223 aa8.3□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 SRMP19623 302 aa8.3□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 HLA-DRB3P79483 266 aa8.3□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 QRFPP83859 136 aa8.3□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 NDPQ00604 133 aa8.3□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 PLGLAQ15195 96 aa8.3□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 SPHARQ15513 63 aa8.3□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 ECSCRQ19T08 205 aa8.3□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 PYHIN1Q6K0P9 492 aa8.3□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 CEACAM19Q7Z692 300 aa8.3□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 C5orf24Q7Z6I8 188 aa8.3□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 MINDY2Q8NBR6 621 aa8.3□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 OR1N2Q8NGR9 330 aa8.3□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 SETD6Q8TBK2 473 aa8.3□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 EDARADDQ8WWZ3 215 aa8.3□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 UFD1Q92890 307 aa8.3□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 RITA1Q96K30 269 aa8.3□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 KLK15Q9H2R5 256 aa8.3□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa8.3□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 U3KQK5 164 aa8.3□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.3□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 A0A1W2PN81 502 aa8.29□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 H0YJW9 148 aa8.29□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 RRHO14718 337 aa8.29□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 RBBP9O75884 186 aa8.29□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 MC5RP33032 325 aa8.29□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 CHRNA7P36544 502 aa8.29□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 RANBP1P43487 201 aa8.29□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 RAB9AP51151 201 aa8.29□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 GNB1P62873 340 aa8.29□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 MED22Q15528 200 aa8.29□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 TRAM1Q15629 374 aa8.29□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 RPL39P5Q59GN2 51 aa8.29□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 C19orf54Q5BKX5 351 aa8.29□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 ASPHD1Q5U4P2 390 aa8.29□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 ZNF429Q86V71 674 aa8.29□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 LPAR5Q9H1C0 372 aa8.29□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 KCNK15Q9H427 330 aa8.29□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 PLGRKTQ9HBL7 147 aa8.29□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 ISYNA1Q9NPH2 558 aa8.29□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 C12orf4Q9NQ89 552 aa8.29□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 SCN3BQ9NY72 215 aa8.29□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 RNF150Q9ULK6 438 aa8.29□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 WASHC3Q9Y3C0 194 aa8.29□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 PTGES3LE9PB15 166 aa8.28□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 H7C2Y5 167 aa8.28□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 OVOL1O14753 267 aa8.28□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 HSPA12AO43301 675 aa8.28□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 ARL6IP5O75915 188 aa8.28□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 SPDEFO95238 335 aa8.28□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 LY86O95711 162 aa8.28□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 CT45A6P0DMU7 189 aa8.28□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 CT45A5P0DMU8 189 aa8.28□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 CT45A7P0DMV0 189 aa8.28□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 CD37P11049 281 aa8.28□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 ARSBP15848 533 aa8.28□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 ZBTB25P24278 435 aa8.28□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 LIPKQ5VXJ0 399 aa8.28□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 OR5AN1Q8NGI8 311 aa8.28□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 ABHD5Q8WTS1 349 aa8.28□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 OR5B12Q96R08 314 aa8.28□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 RNF5Q99942 180 aa8.28□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 AGMATQ9BSE5 352 aa8.28□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 FBXL15Q9H469 300 aa8.28□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 AK3Q9UIJ7 227 aa8.28□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 HSF4Q9ULV5 492 aa8.28□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa8.28□□□□□ -1.08
CYFIP1-205ENST00000612288 A0A0A6YYD4 124 aa8.27□□□□□ -1.09
CYFIP1-205ENST00000612288 LINC01619G3V211 115 aa8.27□□□□□ -1.09
CYFIP1-205ENST00000612288 SLC17A2O00624 439 aa8.27□□□□□ -1.09
CYFIP1-205ENST00000612288 SOCS1O15524 211 aa8.27□□□□□ -1.09
CYFIP1-205ENST00000612288 SOX15O60248 233 aa8.27□□□□□ -1.09
CYFIP1-205ENST00000612288 CD40LGP29965 261 aa8.27□□□□□ -1.09
CYFIP1-205ENST00000612288 CX3CL1P78423 397 aa8.27□□□□□ -1.09
CYFIP1-205ENST00000612288 IRF3Q14653 427 aa8.27□□□□□ -1.09
CYFIP1-205ENST00000612288 RAB11BQ15907 218 aa8.27□□□□□ -1.09
CYFIP1-205ENST00000612288 ACTBL2Q562R1 376 aa8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms