RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607561.1

RNU6-87P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 87, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-87P, Length 108 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-87P-201ENST00000607561 C9J4A7 227 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 SMLR1H3BR10 107 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 SYNGR1O43759 233 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 ORM2P19652 201 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 CD200P41217 278 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 CRATP43155 626 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 PMS2P3Q13401 168 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 ANGPT1Q15389 498 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 TMEM249Q2WGJ8 235 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP0.97□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 PDPK2PQ6A1A2 396 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 TMEM75Q8N9X5 138 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 OR7G1Q8NGA0 311 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 OR4P4Q8NGL7 312 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPACA4Q8TDM5 124 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 MGLLQ99685 303 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 MND1Q9BWT6 205 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP0.97□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 EURLQ9NYK6 297 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 COMMD9Q9P000 198 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 TMEM216Q9P0N5 145 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 PRO2289Q9P1D8 64 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 PSMD13Q9UNM6 376 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 ALG5Q9Y673 324 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 CLUHO75153 1309 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 CHD5Q8TDI0 1954 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 ARRDC5A6NEK1 342 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 M0QYV0 167 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 SULT1C2O00338 296 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 CETN3O15182 167 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 UGT2B11O75310 529 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 TNFAIP8O95379 198 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 LIMS3P0CW19 117 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 LIMS4P0CW20 117 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 ARL14EPLP0DKL9 152 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 CDK2P24941 298 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 KDELR2P33947 212 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 PSMB3P49720 205 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 LINC00313P59037 77 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 TSPEAR-AS2P59090 65 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 ACTBP60709 375 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 FGF12P61328 243 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 ACTG1P63261 375 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 FAM3AP98173 230 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 C2orf91Q6ZV80 131 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 BOD1L2Q8IYS8 172 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 SLC35F6Q8N357 371 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZNF283Q8N7M2 679 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 OR5K1Q8NHB7 308 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 CCDC127Q96BQ5 260 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 LRRC45Q96CN5 670 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 FAM210AQ96ND0 272 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 MED10Q9BTT4 135 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 TIMM21Q9BVV7 248 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 CDCA4Q9BXL8 241 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 ASCL3Q9NQ33 180 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 C1orf109Q9NX04 203 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 CCDC88CQ9P219 2028 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 C11orf86A6NJI1 115 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 H3BPC8 53 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 GOLGA8RI6L899 631 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 PHYHO14832 338 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 CYTH3O43739 400 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 CALUO43852 315 aaPredicted RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 YEATS4O95619 227 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 SYT1P21579 422 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 CRHBPP24387 322 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 OPRM1P35372 400 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 STC1P52823 247 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 GTF2BQ00403 316 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 LRRC26Q2I0M4 334 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 XKRXQ6PP77 449 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 AGTRAPQ6RW13 159 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 CRLF3Q8IUI8 442 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 DEFB119Q8N690 84 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 OR5AK3PQ8NH89 298 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 UGT2B28Q9BY64 529 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 WDR54Q9H977 334 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 LINC00527Q9UJ94 153 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 DNAJC12Q9UKB3 198 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 SNX12Q9UMY4 172 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 C15orf41Q9Y2V0 281 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 RTTNQ86VV8 2226 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 F8VZ95 297 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 ITGB1BP1O14713 200 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 GNRH2O43555 120 aa0.94□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms