RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596941.5

GTPBP3-215, Transcript of GTP binding protein 3, mitochondrial, human

TSL 2

Gene GTPBP3, Length 678 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP3-215	ENST00000596941	SLC35B1	P78383	322 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	C22orf42	Q6IC83	251 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	PDCD5	O14737	125 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	PSMB9	P28065	219 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	CFHR3	Q02985	330 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	COMMD1	Q8N668	190 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	NUDT19	A8MXV4	375 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	ITGB1BP1	O14713	200 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	RAB3B	P20337	219 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	THBS3	P49746	956 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	RAB22A	Q9UL26	194 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	RAB27B	O00194	218 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	MFNG	O00587	321 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	RAB29	O14966	203 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	NBR2	O15453	112 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	CT45A6	P0DMU7	189 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	CT45A5	P0DMU8	189 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	CT45A7	P0DMV0	189 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	GAL	P22466	123 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	TEX38	Q6PEX7	206 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	RAB3C	Q96E17	227 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	DUX3	Q96PT4	197 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941		Q9H521	79 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZFP57	Q9NU63	452 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	HSPA12A	O43301	675 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	PROP1	O75360	226 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	NDUFA3	O95167	84 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	HLA-DRB1	P01911	266 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	IGF1	P05019	195 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	FCGR3A	P08637	254 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZBTB25	P24278	435 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	CEACAM6	P40199	344 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF695	Q8IW36	515 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	RNF152	Q8N8N0	203 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	FCGR1B	Q92637	280 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	P2RX4	Q99571	388 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF580	Q9UK33	172 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941		A0A075B6Q4	140 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	TRDC	B7Z8K6	153 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941		H0YJW9	148 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	ATP6V0E1	O15342	81 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	CD3G	P09693	182 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	GNB3	P16520	340 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	RAB6A	P20340	208 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	VDAC1	P21796	283 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	RANBP1	P43487	201 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	NDP	Q00604	133 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	FOXE3	Q13461	319 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	DEFB136	Q30KP8	78 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF773	Q6PK81	442 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	REC114	Q7Z4M0	266 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	NPB	Q8NG41	125 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	PTX4	Q96A99	478 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	KCTD7	Q96MP8	289 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	RNF150	Q9ULK6	438 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	STUB1	Q9UNE7	303 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR5H14	A6NHG9	310 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-215	ENST00000596941		G3V318	75 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-215	ENST00000596941	FABP7	O15540	132 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-215	ENST00000596941	IGHG4	P01861	327 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-215	ENST00000596941	ELANE	P08246	267 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-215	ENST00000596941	LINC00205	P59089	165 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-215	ENST00000596941	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-215	ENST00000596941	RAX2	Q96IS3	184 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-215	ENST00000596941	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-215	ENST00000596941	GON7	Q9BXV9	100 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP3-215	ENST00000596941	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22

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