RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588551.5

POP4-208, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, human

TSL 3

Gene POP4, Length 789 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POP4-208	ENST00000588551	PTHLH	P12272	177 aa		11.02	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	RORC	P51449	518 aa		11.02	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	PITPNA	Q00169	270 aa		11.02	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	KIR2DS1	Q14954	304 aa		11.02	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	SPCS2	Q15005	226 aa		11.02	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		11.02	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		11.02	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		11.02	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		11.02	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		11.02	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		11.02	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		11.02	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		11.02	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		11.01	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		11.01	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	BET1	O15155	118 aa		11.01	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	DIRAS3	O95661	229 aa		11.01	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	IGKV1D-33	P01593	117 aa		11.01	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	IGKV1-33	P01594	117 aa		11.01	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	CD1B	P29016	333 aa		11.01	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	GNG2	P59768	71 aa		11.01	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		11.01	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551		Q8N6K4	173 aa		11.01	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	PHF21A	Q96BD5	680 aa		11.01	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	NABP2	Q9BQ15	211 aa		11.01	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		11.01	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	RDH8	Q9NYR8	311 aa		11.01	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	RNF150	Q9ULK6	438 aa		11.01	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	RAB29	O14966	203 aa		11	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	TXNL1	O43396	289 aa		11	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	TMEM11	P17152	192 aa		11	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	TMBIM6	P55061	237 aa		11	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	HES1	Q14469	280 aa		11	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		11	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	C11orf88	Q6PI97	169 aa		11	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		11	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		11	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		11	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		11	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		11	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	CMTM3	Q96MX0	182 aa		11	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		11	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		11	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		11	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	HPGDS	O60760	199 aa		10.99	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	HLA-DQB1	P01920	261 aa		10.99	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	APOA1	P02647	267 aa		10.99	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	CT45A6	P0DMU7	189 aa		10.99	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	CT45A5	P0DMU8	189 aa		10.99	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	CT45A7	P0DMV0	189 aa		10.99	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	ELK1	P19419	428 aa		10.99	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	LINC00205	P59089	165 aa		10.99	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	LSAMP	Q13449	338 aa		10.99	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		10.99	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		10.99	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		10.99	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	RITA1	Q96K30	269 aa		10.99	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	GHITM	Q9H3K2	345 aa		10.99	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	SCOC	Q9UIL1	159 aa		10.99	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		10.99	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	MOS	P00540	346 aa		10.98	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	LPL	P06858	475 aa		10.98	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	OR8U9	P0C7N5	309 aa		10.98	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	F2RL1	P55085	397 aa		10.98	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	TAS2R20	P59543	309 aa		10.98	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		10.98	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		10.98	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	CNIH2	Q6PI25	160 aa		10.98	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	HOGA1	Q86XE5	327 aa		10.98	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		10.98	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		10.98	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	OR8U1	Q8NH10	309 aa		10.98	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	S1PR3	Q99500	378 aa		10.98	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	CITED1	Q99966	193 aa		10.98	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		10.98	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		10.98	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	GAB2	Q9UQC2	676 aa		10.98	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		10.98	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551		H3BMQ9	156 aa		10.97	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551		M0QZK8	103 aa		10.97	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	FGF16	O43320	207 aa		10.97	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	FCER2	P06734	321 aa		10.97	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	CTXN2	P0C2S0	81 aa		10.97	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		10.97	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	PRR31	Q5SQ13	230 aa		10.97	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		10.97	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	SNAPC3	Q92966	411 aa		10.97	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	ISOC1	Q96CN7	298 aa		10.97	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	C5orf30	Q96GV9	206 aa		10.97	□□□□□ -0.65
POP4-208	ENST00000588551	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		10.97	□□□□□ -0.65

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