RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 NDUFA5Q16718 116 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 PIGYQ3MUY2 71 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF691Q5VV52 312 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 PXT1Q8NFP0 134 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 CANT1Q8WVQ1 401 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 GNG12Q9UBI6 72 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 KCNK7Q9Y2U2 307 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 CEPT1Q9Y6K0 416 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 A3GALT2U3KPV4 340 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 LANCL1O43813 399 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 SNX3O60493 162 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 RGS11O94810 467 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 HTR1AP08908 422 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 HSMCR30P0CW71 290 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 CD40LGP29965 261 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 DAPP51397 102 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF134P52741 427 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF85Q03923 595 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 LPCAT4Q643R3 524 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 C12orf73Q69YU5 71 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 SIGIRRQ6IA17 410 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 PYHIN1Q6K0P9 492 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 OR51A4Q8NGJ6 313 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 OR5D14Q8NGL3 314 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 OR10K1Q8NGX5 313 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 NEK7Q8TDX7 302 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 RITA1Q96K30 269 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 MS4A10Q96PG2 267 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 GPER1Q99527 375 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 VCX2Q9H322 139 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 RAB9BQ9NP90 201 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 HSF4Q9ULV5 492 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 FBXO7Q9Y3I1 522 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 SHISA3A0PJX4 238 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 AIPO00170 330 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 SPINT2O43291 252 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 FSTP19883 344 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 ZP3P21754 424 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 TPPP2P59282 170 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 NDPQ00604 133 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 IL18Q14116 193 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 LRRC36Q1X8D7 754 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 ACTBL2Q562R1 376 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 ATAD3CQ5T2N8 411 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 LCN12Q6JVE5 192 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 SERPINA12Q8IW75 414 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 AQP12AQ8IXF9 295 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 STX19Q8N4C7 294 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 GLMPQ8WWB7 406 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 ASB9Q96DX5 294 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF581Q9P0T4 197 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 RNF150Q9ULK6 438 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 DHDHQ9UQ10 334 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 CXorf65A6NEN9 183 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 ZAR1LA6NP61 321 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 GABRPO00591 440 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 SHOXO15266 292 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 SSX5O60225 188 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 MITFO75030 526 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 ACTL6BO94805 426 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 CNIH1O95406 144 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 BRI3O95415 125 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 MT-ND4P03905 459 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 CRYGCP07315 174 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 EPHA2P29317 976 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 CX3CL1P78423 397 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 PLGLAQ15195 96 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 DNAL1Q4LDG9 190 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 STEAP3Q658P3 488 aa6.94□□□□□ -1.3
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