RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572369.5

SMG6-211, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 3

Gene SMG6, Length 689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-211ENST00000572369 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa6.22□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 ZNF702PQ9H963 129 aa6.22□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 PIPOXQ9P0Z9 390 aa6.22□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.22□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 ZNF221Q9UK13 617 aa6.22□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 SPATA2Q9UM82 520 aa6.22□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 KCNK7Q9Y2U2 307 aa6.22□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa6.21□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 TMEM235A6NFC5 223 aa6.21□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.21□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 RAB29O14966 203 aa6.21□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 NOL3O60936 208 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 MOSP00540 346 aa6.21□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 GSTT2P0CG29 244 aa6.21□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 GSTT2BP0CG30 244 aa6.21□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 DTYMKP23919 212 aa6.21□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 GPR12P47775 334 aa6.21□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 OR3A3P47888 321 aa6.21□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 PROK1P58294 105 aa6.21□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 NCS1P62166 190 aa6.21□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa6.21□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 UBE2NLQ5JXB2 153 aa6.21□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 HACD4Q5VWC8 232 aa6.21□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 Q6ZPA2 131 aa6.21□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.21□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.21□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.21□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 ABHD14BQ96IU4 210 aa6.21□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 GHITMQ9H3K2 345 aa6.21□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 RNF150Q9ULK6 438 aa6.21□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 A0A0A6YYH2 397 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 A6NJ64 397 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 H7C2Y5 167 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 J3QRK9 145 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 M0QZ24 198 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 RORCP51449 518 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 ZNF137PP52743 207 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 ARPC4P59998 168 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 LSAMPQ13449 338 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 HERPUD1Q15011 391 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 MMDQ15546 238 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 RPL39P5Q59GN2 51 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 IGSF11Q5DX21 431 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 LY6G6FQ5SQ64 297 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 MZT2AQ6P582 158 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 Q6ZS46 218 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 ACOT12Q8WYK0 555 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 SLC25A46Q96AG3 418 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 CITED1Q99966 193 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 NABP2Q9BQ15 211 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 ZNF251Q9BRH9 671 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 IFT46Q9NQC8 304 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 RDH8Q9NYR8 311 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 COL7A1Q02388 2944 aa6.2□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa6.19□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 FAM25AB3EWG3 89 aa6.19□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 FAM25CB3EWG5 89 aa6.19□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 FAM25GB3EWG6 89 aa6.19□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 ITGB1BP1O14713 200 aa6.19□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 FGF16O43320 207 aa6.19□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 FBXO24O75426 580 aa6.19□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 GABARAPO95166 117 aa6.19□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 APOA2P02652 100 aa6.19□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 CTXN2P0C2S0 81 aa6.19□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 OR8U9P0C7N5 309 aa6.19□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 SOX6P35712 828 aa6.19□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 KRTAP10-3P60369 221 aa6.19□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 CBX3Q13185 183 aa6.19□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 EBI3Q14213 229 aa6.19□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 PLGLAQ15195 96 aa6.19□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms