RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		15.5	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	ATP6V1F	Q16864	119 aa		15.5	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		15.5	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	LCN15	Q6UWW0	184 aa		15.5	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		15.5	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		15.5	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	15.5	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	OR4C12	Q96R67	309 aa		15.5	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		15.5	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		15.5	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	VAX2	Q9UIW0	290 aa		15.5	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		15.49	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	LYZL6	O75951	148 aa		15.49	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	HOXC12	P31275	282 aa		15.49	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	TNFSF10	P50591	281 aa		15.49	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		15.49	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		15.49	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559		Q8WTZ3	238 aa		15.49	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		15.49	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	C12orf77	C9JDV5	145 aa		15.49	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	PSPN	O60542	156 aa		15.49	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	CLDN1	O95832	211 aa		15.49	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	OR3A1	P47881	315 aa		15.49	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF726P1	Q15940	193 aa		15.49	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	PRR7	Q8TB68	274 aa		15.49	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	OR2D2	Q9H210	308 aa		15.49	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		15.49	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	VSIR	Q9H7M9	311 aa		15.49	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	15.49	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559		M0R296	226 aa		15.48	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	IGHG3	P01860	377 aa		15.48	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		15.48	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	OR1L1	Q8NH94	360 aa		15.48	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	RBKS	Q9H477	322 aa		15.48	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	TINAG	Q9UJW2	476 aa		15.48	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		15.48	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		15.48	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		15.47	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		15.47	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		15.47	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		15.47	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		15.47	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		15.47	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	NIT2	Q9NQR4	276 aa		15.47	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	15.47	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	TGOLN2	O43493	480 aa		15.47	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559		P0C879	139 aa		15.47	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	HOXA5	P20719	270 aa		15.47	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	ERVFRD-1	P60508	538 aa		15.47	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		15.47	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	15.47	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	15.47	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		15.46	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC30	A6NM36	301 aa		15.46	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	IFNL4	K9M1U5	179 aa		15.46	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	CLN5	O75503	358 aa		15.46	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	15.46	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	KRAS	P01116	189 aa		15.46	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV3-15	P01624	115 aa		15.46	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	HBZ	P02008	142 aa		15.46	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	MB	P02144	154 aa		15.46	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	FABP1	P07148	127 aa		15.46	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	MPV17	P39210	176 aa		15.46	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	15.46	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		15.46	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		15.46	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		15.46	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		15.46	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		15.46	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	CLDN34	H7C241	214 aa		15.46	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	RAMP3	O60896	148 aa		15.46	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	CXCL1	P09341	107 aa		15.46	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	CD82	P27701	267 aa		15.46	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	15.46	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	15.46	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	GUSBP1	Q15486	140 aa		15.46	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		15.46	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		15.46	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	TRIB1	Q96RU8	372 aa		15.46	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	MLNR	O43193	412 aa		15.45	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	CLDN14	O95500	239 aa		15.45	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	S100P	P25815	95 aa		15.45	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	AES	Q08117	197 aa		15.45	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		15.45	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		15.45	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	LHX4	Q969G2	390 aa		15.45	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	LURAP1	Q96LR2	239 aa		15.45	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		15.45	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		15.45	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	OR51M1	Q9H341	326 aa		15.45	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	FRY	Q5TBA9	3013 aa		15.45	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		15.44	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	COX5A	P20674	150 aa		15.44	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	G6PC	P35575	357 aa		15.44	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	15.44	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	RND2	P52198	227 aa		15.44	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	15.44	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		15.44	■□□□□ 0.06

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