RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 HSPB9Q9BQS6 159 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-222ENST00000550996 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
CS-222ENST00000550996 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CS-222ENST00000550996 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
CS-222ENST00000550996 A0A075B6Q4 140 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-222ENST00000550996 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-222ENST00000550996 PSMB11A5LHX3 300 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-222ENST00000550996 SERPINE3A8MV23 424 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-222ENST00000550996 TRDCB7Z8K6 153 aa16.46■□□□□ 0.23
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CS-222ENST00000550996 DAPK2Q9UIK4 370 aa16.46■□□□□ 0.23
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CS-222ENST00000550996 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
CS-222ENST00000550996 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
CS-222ENST00000550996 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa16.44■□□□□ 0.22
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CS-222ENST00000550996 CT45A5P0DMU8 189 aa16.44■□□□□ 0.22
CS-222ENST00000550996 CT45A7P0DMV0 189 aa16.44■□□□□ 0.22
CS-222ENST00000550996 ZBTB25P24278 435 aa16.44■□□□□ 0.22
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CS-222ENST00000550996 MXD1Q05195 221 aa16.44■□□□□ 0.22
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CS-222ENST00000550996 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
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CS-222ENST00000550996 CHPT1Q8WUD6 406 aa16.44■□□□□ 0.22
CS-222ENST00000550996 OR4F4Q96R69 305 aa16.44■□□□□ 0.22
CS-222ENST00000550996 ATG5Q9H1Y0 275 aa16.44■□□□□ 0.22
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CS-222ENST00000550996 PLXNB1O43157 2135 aa16.43■□□□□ 0.22
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CS-222ENST00000550996 FABP7O15540 132 aa16.43■□□□□ 0.22
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CS-222ENST00000550996 GSTT2BP0CG30 244 aa16.43■□□□□ 0.22
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CS-222ENST00000550996 IGSF11Q5DX21 431 aa16.43■□□□□ 0.22
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CS-222ENST00000550996 H0YJW9 148 aa16.42■□□□□ 0.22
CS-222ENST00000550996 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa16.42■□□□□ 0.22
CS-222ENST00000550996 OR4A4PQ8NGN8 299 aa16.42■□□□□ 0.22
CS-222ENST00000550996 RASL11BQ9BPW5 248 aa16.42■□□□□ 0.22
CS-222ENST00000550996 TOLLIPQ9H0E2 274 aa16.42■□□□□ 0.22
CS-222ENST00000550996 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
CS-222ENST00000550996 AP4M1O00189 453 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-222ENST00000550996 TGFBR1P36897 503 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-222ENST00000550996 FOXRED2Q8IWF2 684 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-222ENST00000550996 OR5H6Q8NGV6 325 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-222ENST00000550996 EDARADDQ8WWZ3 215 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-222ENST00000550996 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP16.41■□□□□ 0.22
CS-222ENST00000550996 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-222ENST00000550996 BET1O15155 118 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-222ENST00000550996 SOX6P35712 828 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-222ENST00000550996 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
CS-222ENST00000550996 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
CS-222ENST00000550996 CFHR3Q02985 330 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-222ENST00000550996 BEAN1Q3B7T3 259 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-222ENST00000550996 CDNFQ49AH0 187 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-222ENST00000550996 LCNL1Q6ZST4 164 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-222ENST00000550996 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
CS-222ENST00000550996 TSPAN14Q8NG11 270 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-222ENST00000550996 NPBQ8NG41 125 aa16.4■□□□□ 0.22
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CS-222ENST00000550996 SLC25A38Q96DW6 304 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-222ENST00000550996 YIPF6Q96EC8 236 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-222ENST00000550996 C5orf30Q96GV9 206 aa16.4■□□□□ 0.22
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CS-222ENST00000550996 PF4V1P10720 104 aa16.39■□□□□ 0.21
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CS-222ENST00000550996 C5orf64Q2M2E5 130 aa16.39■□□□□ 0.21
CS-222ENST00000550996 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
CS-222ENST00000550996 OXLD1Q5BKU9 147 aa16.39■□□□□ 0.21
CS-222ENST00000550996 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
CS-222ENST00000550996 ETV3LQ6ZN32 361 aa16.39■□□□□ 0.21
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