RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540904.1

SNHG1-215, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, humanhuman

TSL 5

Gene SNHG1, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG1-215ENST00000540904 GSTT2BP0CG30 244 aa7.35□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 DTYMKP23919 212 aa7.35□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 CD1BP29016 333 aa7.35□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 SERPINB10P48595 397 aa7.35□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 GNG2P59768 71 aa7.35□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 EBI3Q14213 229 aa7.35□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 HERPUD1Q15011 391 aa7.35□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 ZNF260Q3ZCT1 412 aa7.35□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 C9orf152Q5JTZ5 239 aa7.35□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 GPR107Q5VW38 600 aa7.35□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 HACD4Q5VWC8 232 aa7.35□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.35□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa7.35□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 CROCCP3Q8IVE0 287 aa7.35□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 IZUMO1Q8IYV9 350 aa7.35□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 OR4A4PQ8NGN8 299 aa7.35□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa7.35□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.35□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 SLC25A46Q96AG3 418 aa7.35□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 ABHD14BQ96IU4 210 aa7.35□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa7.35□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 RDH8Q9NYR8 311 aa7.35□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 PIPOXQ9P0Z9 390 aa7.35□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 SPATA2Q9UM82 520 aa7.35□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 TRAV18A0A075B6X5 111 aa7.34□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 TMEM127O75204 238 aa7.34□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 PITPNAQ00169 270 aa7.34□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 LSAMPQ13449 338 aa7.34□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 RPL39P5Q59GN2 51 aa7.34□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 GPR141Q7Z602 305 aa7.34□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa7.34□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.34□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 OR10J5Q8NHC4 309 aa7.34□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 S1PR3Q99500 378 aa7.34□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 NABP2Q9BQ15 211 aa7.34□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 GINS4Q9BRT9 223 aa7.34□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 AGMATQ9BSE5 352 aa7.34□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 CABLES2Q9BTV7 478 aa7.34□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 DIABLOQ9NR28 239 aa7.34□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 RNF150Q9ULK6 438 aa7.34□□□□□ -1.23
SNHG1-215ENST00000540904 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa7.33□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa7.33□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 A0A0A6YYH2 397 aa7.33□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 A6NJ64 397 aa7.33□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 M0QZ24 198 aa7.33□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 ITGB1BP1O14713 200 aa7.33□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 FGF16O43320 207 aa7.33□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 SSX5O60225 188 aa7.33□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 GABARAPO95166 117 aa7.33□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 TFAP2AP05549 437 aa7.33□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 GPR12P47775 334 aa7.33□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 CTF1Q16619 201 aa7.33□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa7.33□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 UBE2NLQ5JXB2 153 aa7.33□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 PRR31Q5SQ13 230 aa7.33□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 FAM71F2Q6NXP2 309 aa7.33□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 Q6ZS49 121 aa7.33□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 Q8N6K4 173 aa7.33□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 SAMD12Q8N8I0 201 aa7.33□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 ZNF251Q9BRH9 671 aa7.33□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.33□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 ABCG5Q9H222 651 aa7.33□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 DCSTAMPQ9H295 470 aa7.33□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 GHITMQ9H3K2 345 aa7.33□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 ZNF221Q9UK13 617 aa7.33□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 FBXO24O75426 580 aa7.32□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 DIRAS3O95661 229 aa7.32□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 FCER2P06734 321 aa7.32□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 OR8U9P0C7N5 309 aa7.32□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 CT45A6P0DMU7 189 aa7.32□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 CT45A5P0DMU8 189 aa7.32□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 CT45A7P0DMV0 189 aa7.32□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 CD28P10747 220 aa7.32□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 PTHLHP12272 177 aa7.32□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 ALDH3B2P48448 385 aa7.32□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 RORCP51449 518 aa7.32□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 F2RL1P55085 397 aa7.32□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 ACTBP60709 375 aa7.32□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 MMDQ15546 238 aa7.32□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 FAM131AQ6UXB0 335 aa7.32□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 Q8N9W7 124 aa7.32□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 OR5AU1Q8NGC0 362 aa7.32□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 OR8H1Q8NGG4 311 aa7.32□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 OR8U1Q8NH10 309 aa7.32□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 RITA1Q96K30 269 aa7.32□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 RASL11BQ9BPW5 248 aa7.32□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 OR2D2Q9H210 308 aa7.32□□□□□ -1.24
SNHG1-215ENST00000540904 AUNIPQ9H7T9 357 aa7.32□□□□□ -1.24
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