RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 MEOX1P50221 254 aa22.83■■□□□ 1.24
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF146Q15072 292 aa22.83■■□□□ 1.24
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SH3BP2-221ENST00000511747 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
SH3BP2-221ENST00000511747 GPR61Q9BZJ8 451 aa22.83■■□□□ 1.24
SH3BP2-221ENST00000511747 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
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SH3BP2-221ENST00000511747 IGKV1-33P01594 117 aa22.8■■□□□ 1.24
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SH3BP2-221ENST00000511747 PHOX2AO14813 284 aa22.77■■□□□ 1.24
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SH3BP2-221ENST00000511747 OR2D2Q9H210 308 aa22.77■■□□□ 1.24
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SH3BP2-221ENST00000511747 RPL30P62888 115 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2-221ENST00000511747 IL17BQ9UHF5 180 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2-221ENST00000511747 OR5H1A6NKK0 313 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-221ENST00000511747 ACSM6Q6P461 480 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-221ENST00000511747 MDS2Q8NDY4 140 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-221ENST00000511747 NAT8Q9UHE5 227 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-221ENST00000511747 TLE1Q04724 770 aa22.75■■□□□ 1.23
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