RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 HSPB9Q9BQS6 159 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 DAPK2Q9UIK4 370 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2-218ENST00000511185 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 S1PR3Q99500 378 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 PSMB11A5LHX3 300 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHG2P01859 326 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 OPN1MWP04001 364 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 OPN1MW2P0DN77 364 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 OPN1MW3P0DN78 364 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR12P47775 334 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 DEFA6Q01524 100 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM131AQ6UXB0 335 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC35E3Q7Z769 313 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 R3HDM4Q96D70 268 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 KCTD7Q96MP8 289 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 AGMATQ9BSE5 352 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 ATG5Q9H1Y0 275 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 SERPINE3A8MV23 424 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 CEACAM6P40199 344 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 MMDQ15546 238 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 IGSF11Q5DX21 431 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 OR4X2Q8NGF9 303 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 OR5H6Q8NGV6 325 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 ABCG5Q9H222 651 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAH3Q8TD57 4116 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 TRDCB7Z8K6 153 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 G3V4G9 280 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 FABP7O15540 132 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 HSPA12AO43301 675 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 GSTT2P0CG29 244 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 GSTT2BP0CG30 244 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 ZBTB25P24278 435 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 LINC00205P59089 165 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 ACTBP60709 375 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 C18orf65Q6ZTR6 163 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 TPRA1Q86W33 373 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 STPG2Q8N412 459 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 PTX4Q96A99 478 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC25A38Q96DW6 304 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 C5orf30Q96GV9 206 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 CABLES2Q9BTV7 478 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 RDH8Q9NYR8 311 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF150Q9ULK6 438 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 MGAT4AQ9UM21 535 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 PROP1O75360 226 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 TNFAIP8O95379 198 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 CT45A6P0DMU7 189 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 CT45A5P0DMU8 189 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 CT45A7P0DMV0 189 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM71F2Q6NXP2 309 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 LCNL1Q6ZST4 164 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 TSPAN14Q8NG11 270 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 YIPF6Q96EC8 236 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 PIPOXQ9P0Z9 390 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 METTL21EPA6NDL7 271 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM235A6NFC5 223 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 ITGB1BP1O14713 200 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 RAB29O14966 203 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 BET1O15155 118 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 RANBP1P43487 201 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 ARFRP1Q13795 201 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 OR4A4PQ8NGN8 299 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 CHPT1Q8WUD6 406 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 RASL11BQ9BPW5 248 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 RHBDL2Q9NX52 303 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 H0YJW9 148 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 LSM3P62310 102 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 IDNKQ5T6J7 187 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 FOXRED2Q8IWF2 684 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 OR4F17Q8NGA8 305 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 OR8H1Q8NGG4 311 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 EDARADDQ8WWZ3 215 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 OR4F4Q96R69 305 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 NOTCH3Q9UM47 2321 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A087WXM4 84 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 AP4M1O00189 453 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 NBR2O15453 112 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 PF4V1P10720 104 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 SOX6P35712 828 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 NDPQ00604 133 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 CFHR3Q02985 330 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 KIR2DS1Q14954 304 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 SAMD5Q5TGI4 173 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 ETV3LQ6ZN32 361 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2D2Q9H210 308 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 OR5H14A6NHG9 310 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM64CA6NLI5 447 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms