RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 CROCCP3Q8IVE0 287 aa16.74■□□□□ 0.27
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SH3BP2-210ENST00000505941 CHPT1Q8WUD6 406 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 GON7Q9BXV9 100 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 KCNK7Q9Y2U2 307 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 PSMB11A5LHX3 300 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 MFNGO00587 321 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 KCNAB3O43448 404 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 FCGR3AP08637 254 aa16.73■□□□□ 0.27
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SH3BP2-210ENST00000505941 PITPNAQ00169 270 aa16.73■□□□□ 0.27
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SH3BP2-210ENST00000505941 ODF3L1Q8IXM7 274 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 Q8N6K4 173 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
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SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF251Q9BRH9 671 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 OR1A1Q9P1Q5 309 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 ETV7Q9Y603 341 aa16.73■□□□□ 0.27
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SH3BP2-210ENST00000505941 MC5RP33032 325 aa16.72■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 GPR12P47775 334 aa16.72■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP16.72■□□□□ 0.271e-6■□□□□ 9
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SH3BP2-210ENST00000505941 ABHD14BQ96IU4 210 aa16.72■□□□□ 0.27
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SH3BP2-210ENST00000505941 ABCG5Q9H222 651 aa16.72■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 IFI27L2Q9H2X8 130 aa16.72■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 RNF167Q9H6Y7 350 aa16.72■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 MGAM2Q2M2H8 2515 aa16.72■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 AP4M1O00189 453 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 CLEC2LP0C7M8 214 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 SOX6P35712 828 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 CD83Q01151 205 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 MMDQ15546 238 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 Q8N9W7 124 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP16.71■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 RHBDL2Q9NX52 303 aa16.71■□□□□ 0.27
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SH3BP2-210ENST00000505941 KIAA1456Q9P272 454 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 RNF150Q9ULK6 438 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP2-210ENST00000505941 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
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SH3BP2-210ENST00000505941 GSTT2BP0CG30 244 aa16.7■□□□□ 0.26
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SH3BP2-210ENST00000505941 F2RL1P55085 397 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP2-210ENST00000505941 GNG2P59768 71 aa16.7■□□□□ 0.26
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SH3BP2-210ENST00000505941 HACD4Q5VWC8 232 aa16.7■□□□□ 0.26
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SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
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SH3BP2-210ENST00000505941 OR5H14A6NHG9 310 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP2-210ENST00000505941 PF4V1P10720 104 aa16.69■□□□□ 0.26
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SH3BP2-210ENST00000505941 RPL39P5Q59GN2 51 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP2-210ENST00000505941 YIPF6Q96EC8 236 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP2-210ENST00000505941 AGMATQ9BSE5 352 aa16.69■□□□□ 0.26
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SH3BP2-210ENST00000505941 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP2-210ENST00000505941 A6NJ64 397 aa16.67■□□□□ 0.26
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SH3BP2-210ENST00000505941 CT45A6P0DMU7 189 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP2-210ENST00000505941 CT45A5P0DMU8 189 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP2-210ENST00000505941 CT45A7P0DMV0 189 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM131AQ6UXB0 335 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP2-210ENST00000505941 STPG2Q8N412 459 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP2-210ENST00000505941 CABLES2Q9BTV7 478 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP2-210ENST00000505941 LINC00527Q9UJ94 153 aa16.67■□□□□ 0.26
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