RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493618.5

ATG4B-223, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, human

TSL 5

Gene ATG4B, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4B-223	ENST00000493618	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	OR11H1	Q8NG94	326 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	PRR25	Q96S07	402 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	LRRC42	Q9Y546	428 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	RGS10	O43665	173 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	CT45A6	P0DMU7	189 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	CT45A5	P0DMU8	189 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	CT45A7	P0DMV0	189 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	OR5H8	P0DN80	308 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	CD37	P11049	281 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	ARSB	P15848	533 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	VEGFC	P49767	419 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	ECSCR	Q19T08	205 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	LIN54	Q6MZP7	749 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM65	Q6PI78	240 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	B9D2	Q9BPU9	175 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	FBXL15	Q9H469	300 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	KIAA1456	Q9P272	454 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618		H7C2Y5	167 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC17A2	O00624	439 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	RAB29	O14966	203 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	SCT	P09683	121 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	CEACAM6	P40199	344 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	ECI1	P42126	302 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	GNB1	P62873	340 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	HLA-DRB3	P79483	266 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	NDP	Q00604	133 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	PLA2G7	Q13093	441 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	TPBG	Q13641	420 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	RAB11B	Q15907	218 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	NPB	Q8NG41	125 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	CLCC1	Q96S66	551 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	DUSP21	Q9H596	190 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF580	Q9UK33	172 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	RNF150	Q9ULK6	438 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618		A0A1W2PN81	502 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	FCN1	O00602	326 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	HSPA12A	O43301	675 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	NDUFA3	O95167	84 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	IGLV1-40	P01703	118 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	CPE	P16870	476 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	CHRNA7	P36544	502 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM50B	P56557	158 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	LINC00205	P59089	165 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	FABP5	Q01469	135 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	FHL3	Q13643	280 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	PLGLA	Q15195	96 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	HES5	Q5TA89	166 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	PECR	Q9BY49	303 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618		Q9N2K0	584 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	SCOC	Q9UIL1	159 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	VSIG4	Q9Y279	399 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618		H0YJW9	148 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618		I3L521	148 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	RRH	O14718	337 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	RAB9A	P51151	201 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	TRAM1	Q15629	374 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	GAB2	Q9UQC2	676 aa		11.38	□□□□□ -0.59

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms