RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF11Q9Y3C5 154 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAV40A0A0B4J280 105 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 NDUFS8O00217 210 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 UPK1AO00322 258 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 BPY2O14599 106 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 RAD51CO43502 376 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 REM1O75628 298 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 KRT14P02533 472 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 CD5P06127 495 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 MSMBP08118 114 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 OR8U9P0C7N5 309 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 CECR9P0C854 216 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 OPRK1P41145 380 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 EVX1P49640 407 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 AP1S2P56377 157 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 RWDD2BP57060 319 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 ERVS71-1P61550 626 aa1.77□□□□□ -2.13
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RABGGTB-211ENST00000489450 PITPNAQ00169 270 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 FUT5Q11128 374 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF266Q14584 549 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAM2Q15035 370 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 SPA17Q15506 151 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 DEFB112Q30KQ8 113 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 TIMM23BQ5SRD1 257 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 HBMQ6B0K9 141 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC48A1Q6P1K1 146 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 NECAP1Q8NC96 275 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 OR7G1Q8NGA0 311 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 OR4K17Q8NGC6 315 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 OR52E2Q8NGJ4 325 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF675Q8TD23 568 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 GPR119Q8TDV5 335 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 APH1BQ8WW43 257 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 TMIGD2Q96BF3 282 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 ARL5BQ96KC2 179 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 PRRC1Q96M27 445 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC42Q96M95 316 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 ALS2CR12Q96Q35 445 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 ANKRD60Q9BZ19 345 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 IL22Q9GZX6 179 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM165Q9HC07 324 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 CA10Q9NS85 328 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 MTCH1Q9NZJ7 389 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC17A7Q9P2U7 560 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 SIGLEC9Q9Y336 463 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 HMCN2Q8NDA2 5059 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa1.76□□□□□ -2.13
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RABGGTB-211ENST00000489450 C5orf63A6NC05 138 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 B4DSR2 109 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 H0YJW9 148 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 H7C1H1 209 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 hCG_2039718K7EN88 272 aa1.76□□□□□ -2.13
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RABGGTB-211ENST00000489450 ACOX3O15254 700 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 SOCS1O15524 211 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP5-8O75690 187 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 OR2F2O95006 317 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 TTC4O95801 387 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 HLA-DQA1P01909 254 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 KLK1P06870 262 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 IL3P08700 152 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 OR4A8P0C604 315 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 MYL2P10916 166 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 IL32P24001 234 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 PAX6P26367 422 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 FOXA1P55317 472 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 CTBP2P56545 445 aa1.76□□□□□ -2.13
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RABGGTB-211ENST00000489450 CDK5Q00535 292 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 IFT88Q13099 833 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 RCN1Q15293 331 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 MAPK14Q16539 360 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 CPTPQ5TA50 214 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 MED27Q6P2C8 311 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 ZFP1Q6P2D0 407 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 C4orf22Q6V702 233 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC16A13Q7RTY0 426 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 NEGR1Q7Z3B1 354 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 COMMD6Q7Z4G1 85 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-211ENST00000489450 CBLN2Q8IUK8 224 aa1.76□□□□□ -2.13
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