RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 KCNIP1Q9NZI2 227 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 JPT1Q9UK76 154 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A1W2PN81 502 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM90A7PA6NKC0 464 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 YPEL1O60688 119 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 DEDDO75618 318 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV3-11P01762 117 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 IFNA6P05013 189 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 MYL12AP19105 171 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 CHRNA7P36544 502 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 CX3CL1P78423 397 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 YIF1BQ5BJH7 314 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 C6orf141Q5SZD1 244 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM131AQ6UXB0 335 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 LYPD6Q86Y78 171 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF485Q8NCK3 441 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 OR2AK2Q8NG84 335 aa7.23□□□□□ -1.25
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SMARCE1-210ENST00000481231 ABHD5Q8WTS1 349 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM46BQ96A09 425 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 PGLYRP3Q96LB9 341 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 YPEL2Q96QA6 119 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 FBXL15Q9H469 300 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 GAB2Q9UQC2 676 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 ERGIC3Q9Y282 383 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 FCN1O00602 326 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 RRHO14718 337 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 ST8SIA5O15466 376 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 RGS11O94810 467 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 BAG2O95816 211 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 CT45A6P0DMU7 189 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 CT45A5P0DMU8 189 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 CT45A7P0DMV0 189 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 PITPNAQ00169 270 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 HMGN3Q15651 99 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 HAGHQ16775 308 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 ACTBL2Q562R1 376 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 RPL39P5Q59GN2 51 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 LY6G6FQ5SQ64 297 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM71F2Q6NXP2 309 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 CDH26Q8IXH8 852 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 Q8N1Y9 231 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 GALMQ96C23 342 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 DERL3Q96Q80 235 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 SULT4A1Q9BR01 284 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 GHITMQ9H3K2 345 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 IRGMA1A4Y4 181 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 H0YJW9 148 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 CAPGP40121 348 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 TPPP2P59282 170 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 PLGLAQ15195 96 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 PYHIN1Q6K0P9 492 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 PPP1R27Q86WC6 154 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 PQLC1Q8N2U9 271 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 IL1F10Q8WWZ1 152 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 MS4A10Q96PG2 267 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 OR4C12Q96R67 309 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 UQCC2Q9BRT2 126 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC23A1Q9UHI7 598 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5H14A6NHG9 310 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 DYNC1I1O14576 645 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 RAB29O14966 203 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 HSPA12AO43301 675 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 IGLV1-51P01701 117 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 AKIRIN2Q53H80 203 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 OR10K2Q6IF99 312 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 C6orf201Q7Z4U5 140 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 SVOPQ8N4V2 548 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 NKAIN3Q8N8D7 197 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF555Q8NEP9 628 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 LFNGQ8NES3 379 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5AN1Q8NGI8 311 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM80Q96HE8 168 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 RHOVQ96L33 236 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 NEDD4LQ96PU5 975 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 FAAP24Q9BTP7 215 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 RSRP1Q9BUV0 290 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 ELOVL1Q9BW60 279 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 S100A14Q9HCY8 104 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
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