RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 AIREO43918 545 aa7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 IGHG2P01859 326 aa7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 TALDO1P37837 337 aa7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 LSM3P62310 102 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 CD83Q01151 205 aa7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 ARL6IP1Q15041 203 aa7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 ZNF260Q3ZCT1 412 aa7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 IGSF11Q5DX21 431 aa7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 FAM71F2Q6NXP2 309 aa7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 C10orf99Q6UWK7 81 aa7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 NDUFA11Q86Y39 141 aa7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 OR8H1Q8NGG4 311 aa7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 OR4A4PQ8NGN8 299 aa7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 OR5H6Q8NGV6 325 aa7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 LGALS14Q8TCE9 139 aa7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 MAFIPQ8WZ33 124 aa7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 RITA1Q96K30 269 aa7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 S1PR3Q99500 378 aa7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 RASL11BQ9BPW5 248 aa7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 ZNF251Q9BRH9 671 aa7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 AGMATQ9BSE5 352 aa7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 ABCG5Q9H222 651 aa7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 RDH8Q9NYR8 311 aa7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 RNF150Q9ULK6 438 aa7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.24□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 BET1O15155 118 aa7.24□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 RRP9O43818 475 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 PROP1O75360 226 aa7.24□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 SCGNO76038 276 aa7.24□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 CT45A6P0DMU7 189 aa7.24□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 CT45A5P0DMU8 189 aa7.24□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 CT45A7P0DMV0 189 aa7.24□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 RPS19P39019 145 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 SERPINB10P48595 397 aa7.24□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 SCAND1P57086 179 aa7.24□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 KIR2DS1Q14954 304 aa7.24□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 RPL39P5Q59GN2 51 aa7.24□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa7.24□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 HACD4Q5VWC8 232 aa7.24□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 SLC35E3Q7Z769 313 aa7.24□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa7.24□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 TOLLIPQ9H0E2 274 aa7.24□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 RHBDL2Q9NX52 303 aa7.24□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 LINC00527Q9UJ94 153 aa7.24□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 ETV7Q9Y603 341 aa7.24□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.24□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa7.23□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa7.23□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa7.23□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 PSMB11A5LHX3 300 aa7.23□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 TMEM127O75204 238 aa7.23□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 DTYMKP23919 212 aa7.23□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 CNTFRP26992 372 aa7.23□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 MC5RP33032 325 aa7.23□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 GPR12P47775 334 aa7.23□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 ACTBP60709 375 aa7.23□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 PITPNAQ00169 270 aa7.23□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 MMDQ15546 238 aa7.23□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 Q6ZS49 121 aa7.23□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 ZNF329Q86UD4 541 aa7.23□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 CROCCP3Q8IVE0 287 aa7.23□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 FOXRED2Q8IWF2 684 aa7.23□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa7.23□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 OR4X2Q8NGF9 303 aa7.23□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 OR10J5Q8NHC4 309 aa7.23□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 CHPT1Q8WUD6 406 aa7.23□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 PHF21AQ96BD5 680 aa7.23□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 SLC25A38Q96DW6 304 aa7.23□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 CABLES2Q9BTV7 478 aa7.23□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 FUNDC2Q9BWH2 189 aa7.23□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 ZNF221Q9UK13 617 aa7.23□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 SPATA2Q9UM82 520 aa7.23□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 GAB2Q9UQC2 676 aa7.23□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 TRAV18A0A075B6X5 111 aa7.22□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 A0A1W2PRX2 142 aa7.22□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 TMEM235A6NFC5 223 aa7.22□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 H0YJW9 148 aa7.22□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 AP4M1O00189 453 aa7.22□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 DIRAS3O95661 229 aa7.22□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 OPN1MWP04001 364 aa7.22□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 OR8U9P0C7N5 309 aa7.22□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 OPN1MW2P0DN77 364 aa7.22□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 OPN1MW3P0DN78 364 aa7.22□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 SOX6P35712 828 aa7.22□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 LINC00205P59089 165 aa7.22□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 GNG2P59768 71 aa7.22□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa7.22□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 FAM131AQ6UXB0 335 aa7.22□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 STPG2Q8N412 459 aa7.22□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 NPBQ8NG41 125 aa7.22□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 OR5AN1Q8NGI8 311 aa7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms