RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	SPIN2A	Q99865	258 aa		10.16	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		10.16	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		10.16	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		10.16	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		10.16	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		10.16	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	RNF222	A6NCQ9	220 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435		H0YIZ8	118 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	ITGB1BP1	O14713	200 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	LY6H	O94772	140 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	DAO	P14920	347 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	NFYB	P25208	207 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	S100A11	P31949	105 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	SMCO1	Q147U7	214 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	TIMD4	Q96H15	378 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	ARL6	Q9H0F7	186 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	NBAS	A2RRP1	2371 aa		10.15	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A0D9SG52	128 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC31A2	O15432	143 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	OR2F2	O95006	317 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	IGHV3-7	P01780	117 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	LYL1	P12980	280 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	CCL3L1	P16619	93 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	VDAC1	P21796	283 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	CDKN1A	P38936	164 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	RAB7A	P51149	207 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	OR2F1	Q13607	317 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	ESCO2	Q56NI9	601 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	NMS	Q5H8A3	153 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	OR1S1	Q8NH92	325 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	LEAP2	Q969E1	77 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	RNF126	Q9BV68	326 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	ZFP57	Q9NU63	452 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	CACNA1B	Q00975	2339 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435		K7EPK0	472 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	DEDD	O75618	318 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	MMP23A	O75900	390 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	CLDN1	O95832	211 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	IGKV1-39	P01597	117 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	IGKV1D-39	P04432	117 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	GNG10	P50151	68 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	AKR1C2	P52895	323 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF585B	Q52M93	769 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	UTF1	Q5T230	341 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	RAB1C	Q92928	201 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	OR8B2	Q96RD0	313 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	CHODL	Q9H9P2	273 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	ROS1	P08922	2347 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A1W2PPE3	182 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435		M0R1X1	148 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	BCL2L11	O43521	198 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	RLN2	P04090	185 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	EPHA1	P21709	976 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	LPAR6	P43657	344 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF134	P52741	427 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDLBP-231	ENST00000467435	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		10.12	□□□□□ -0.79

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