RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462421.1

DDX39B-216, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 618 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-216ENST00000462421 GNMTQ14749 295 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 SSX1Q16384 188 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 RTL8BQ17RB0 113 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 CT45A1Q5HYN5 189 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 IDNKQ5T6J7 187 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 SIGIRRQ6IA17 410 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 REC114Q7Z4M0 266 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 GAPTQ8N292 157 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 CT45A3Q8NHU0 189 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 Q9N2K0 584 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 PARP11Q9NR21 331 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 WASHC3Q9Y3C0 194 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 ETV7Q9Y603 341 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 ITGB1BP1O14713 200 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 SLC31A2O15432 143 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 SLC22A5O76082 557 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 ACTL6BO94805 426 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 NAPSAO96009 420 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 TFAP2AP05549 437 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 RRASP10301 218 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 GNB3P16520 340 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 SCAND1P57086 179 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 OR10A3P58181 314 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 KRTAP10-3P60369 221 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 ACTBP60709 375 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 QRFPP83859 136 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 LIN54Q6MZP7 749 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 SFXN4Q6P4A7 337 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 ZNF329Q86UD4 541 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 LYPD6Q86Y78 171 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 STPG2Q8N412 459 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 FAM89BQ8N5H3 189 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 ZNF439Q8NDP4 499 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 TSPAN14Q8NG11 270 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 ADTRPQ96IZ2 230 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 ABCG5Q9H222 651 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 IFT46Q9NQC8 304 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 SMIM30A4D0T7 59 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 M0R1X1 148 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 AIREO43918 545 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 NOL3O60936 208 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 CNIH1O95406 144 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 DIRAS3O95661 229 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 IGHG2P01859 326 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 FCGR3AP08637 254 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 RPS16P62249 146 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 EBI3Q14213 229 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 FAM131AQ6UXB0 335 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 PDPNQ86YL7 162 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 OR8U1Q8NH10 309 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 RNF5Q99942 180 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 OR2D2Q9H210 308 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 RDH8Q9NYR8 311 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 A0A0A6YYD4 124 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 A0A0A6YYH2 397 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 A6NJ64 397 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 MPPED1O15442 326 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 SPDEFO95238 335 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 ELANEP08246 267 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 SCTP09683 121 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 DTYMKP23919 212 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 S100GP29377 79 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 SDC2P34741 201 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 CBX5P45973 191 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 OR3A3P47888 321 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 THBS3P49746 956 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 CD83Q01151 205 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 FOXE3Q13461 319 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 ECSCRQ19T08 205 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 VMA21Q3ZAQ7 101 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 CDNFQ49AH0 187 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 RPL39P5Q59GN2 51 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 PYHIN1Q6K0P9 492 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 ZNF880Q6PDB4 577 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 C1QL4Q86Z23 238 aa7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms