RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa10.46□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 PRR18Q8N4B5 295 aa10.46□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 FAM89BQ8N5H3 189 aa10.46□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 OR4X2Q8NGF9 303 aa10.46□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 PPP1R14BQ96C90 147 aa10.46□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 DIRAS2Q96HU8 199 aa10.46□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 NEDD4LQ96PU5 975 aa10.46□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 GFI1Q99684 422 aa10.46□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 FAAP24Q9BTP7 215 aa10.46□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM59Q9BXS4 323 aa10.46□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 KCNIP1Q9NZI2 227 aa10.46□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 JPT1Q9UK76 154 aa10.46□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 PLXNB1O43157 2135 aa10.46□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 SLC17A2O00624 439 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 LANCL1O43813 399 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 YPEL1O60688 119 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 PTTG1O95997 202 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 NAPSAO96009 420 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 TALDO1P37837 337 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 RANBP1P43487 201 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 HMGN3Q15651 99 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 SFXN4Q6P4A7 337 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF880Q6PDB4 577 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 OR2W3Q7Z3T1 314 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 C6orf201Q7Z4U5 140 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 C5orf24Q7Z6I8 188 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 CENPSQ8N2Z9 138 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 Q8N9W7 124 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 OR8H1Q8NGG4 311 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 OR52L2PQ8NGH6 319 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 OR10V1Q8NGI7 309 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 YPEL2Q96QA6 119 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 NICN1Q9BSH3 213 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 LPAR5Q9H1C0 372 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 ABCG5Q9H222 651 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 PSMB11A5LHX3 300 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 FABP12A6NFH5 140 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 MOSP00540 346 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 SCAND1P57086 179 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 OXA1LQ15070 435 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 OXLD1Q5BKU9 147 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 NKAPLQ5M9Q1 402 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 FAM131AQ6UXB0 335 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 LYSMD2Q8IV50 215 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 LAX1Q8IWV1 398 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 ODF3L1Q8IXM7 274 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 GALMQ96C23 342 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 COMMD3Q9UBI1 195 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 V9GYH0 126 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 NOTCH3Q9UM47 2321 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 A0A0A6YYD4 124 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 A0A1W2PRX2 142 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 SHISA3A0PJX4 238 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 LINC01548A6NM66 108 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 ARSBP15848 533 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM50BP56557 158 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 GNMTQ14749 295 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 IDNKQ5T6J7 187 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 Q6ZPA2 131 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 SLC35E3Q7Z769 313 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF329Q86UD4 541 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 COMMD1Q8N668 190 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 S1PR3Q99500 378 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 SRRQ9GZT4 340 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 MIXL1Q9H2W2 232 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 KCNK15Q9H427 330 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 ZFP57Q9NU63 452 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 HSF4Q9ULV5 492 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 SERPINE3A8MV23 424 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 FAM25AB3EWG3 89 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 FAM25CB3EWG5 89 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 FAM25GB3EWG6 89 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 LDLRAD4O15165 306 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 SOCS1O15524 211 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 RGS11O94810 467 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 F2RL1P55085 397 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 C2orf76Q3KRA6 126 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 HACD4Q5VWC8 232 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 FOXRED2Q8IWF2 684 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 STPG2Q8N412 459 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 POC5Q8NA72 575 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 V9GY05 133 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 AP4M1O00189 453 aa10.41□□□□□ -0.74
C9orf3-210ENST00000462125 ITGB1BP1O14713 200 aa10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.1 ms