RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264389.6

COPS4-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS4, Length 1,744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4-201ENST00000264389 L7N2F9 121 aa6.85□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 SERPINE2P07093 398 aa6.85□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 RAB7AP51149 207 aa6.85□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 S100A10P60903 97 aa6.85□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 TMEM155Q4W5P6 130 aa6.85□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa6.85□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.85□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 BTNL3Q6UXE8 466 aa6.85□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.85□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 OR10A7Q8NGE5 316 aa6.85□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
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COPS4-201ENST00000264389 RAB39BQ96DA2 213 aa6.85□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 TMEM56Q96MV1 263 aa6.85□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 SPIN2AQ99865 258 aa6.85□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6.85□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.85□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 GSKIPQ9P0R6 139 aa6.85□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 MBD2Q9UBB5 411 aa6.85□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 MIOXQ9UGB7 285 aa6.85□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.85□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.85□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 USF3Q68DE3 2245 aa6.85□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 HMSDA8MTL9 139 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 ITGB1BP1O14713 200 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 TSC22D2O75157 780 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 SNAPC5O75971 98 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 MPC2O95563 127 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 CDS2O95674 445 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 SCGB1D2O95969 90 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 IGHV3-7P01780 117 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 SLC25A4P12235 298 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 CCL3L1P16619 93 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 C4BPBP20851 252 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 PSMB6P28072 239 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 GNG10P50151 68 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 DCUN1D4Q92564 292 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 LEAP2Q969E1 77 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 C5orf30Q96GV9 206 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 AGMATQ9BSE5 352 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 LINC00574Q9H8X3 128 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 SDHAF2Q9NX18 166 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 J3QL48 77 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 SLC31A2O15432 143 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 MMP23AO75900 390 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 RPA2P15927 270 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 SSTR2P30874 369 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 EFNA4P52798 201 aa6.84□□□□□ -1.31
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COPS4-201ENST00000264389 SMCO1Q147U7 214 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 HEPN1Q6WQI6 88 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.84□□□□□ -1.31
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COPS4-201ENST00000264389 CCL19Q99731 98 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 SLA2Q9H6Q3 261 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 NARFLQ9H6Q4 476 aa6.84□□□□□ -1.31
COPS4-201ENST00000264389 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
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COPS4-201ENST00000264389 A0A1W2PPE3 182 aa6.83□□□□□ -1.32
COPS4-201ENST00000264389 A0A1W2PPH5 198 aa6.83□□□□□ -1.32
COPS4-201ENST00000264389 M0R1X1 148 aa6.83□□□□□ -1.32
COPS4-201ENST00000264389 NDUFS7O75251 213 aa6.83□□□□□ -1.32
COPS4-201ENST00000264389 CLDN1O95832 211 aa6.83□□□□□ -1.32
COPS4-201ENST00000264389 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
COPS4-201ENST00000264389 COX6B1P14854 86 aa6.83□□□□□ -1.32
COPS4-201ENST00000264389 CXCL2P19875 107 aa6.83□□□□□ -1.32
COPS4-201ENST00000264389 VDAC1P21796 283 aa6.83□□□□□ -1.32
COPS4-201ENST00000264389 AKR1C2P52895 323 aa6.83□□□□□ -1.32
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COPS4-201ENST00000264389 GNB2P62879 340 aa6.83□□□□□ -1.32
COPS4-201ENST00000264389 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
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COPS4-201ENST00000264389 ZNF546Q86UE3 836 aa6.83□□□□□ -1.32
COPS4-201ENST00000264389 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6.83□□□□□ -1.32
COPS4-201ENST00000264389 LYG1Q8N1E2 194 aa6.83□□□□□ -1.32
COPS4-201ENST00000264389 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa6.83□□□□□ -1.32
COPS4-201ENST00000264389 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.83□□□□□ -1.32
COPS4-201ENST00000264389 GON7Q9BXV9 100 aa6.83□□□□□ -1.32
COPS4-201ENST00000264389 MFFQ9GZY8 342 aa6.83□□□□□ -1.32
COPS4-201ENST00000264389 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
COPS4-201ENST00000264389 EPG5Q9HCE0 2579 aa6.83□□□□□ -1.32
COPS4-201ENST00000264389 ZNF462Q96JM2 2506 aa6.82□□□□□ -1.32
COPS4-201ENST00000264389 A1L4Q6 167 aa6.82□□□□□ -1.32
COPS4-201ENST00000264389 RAB29O14966 203 aa6.82□□□□□ -1.32
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