RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 PTHLHP12272 177 aa17.76■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 CD1BP29016 333 aa17.76■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 TALDO1P37837 337 aa17.76■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 RORCP51449 518 aa17.76■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 UBE2NLQ5JXB2 153 aa17.76■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 SAMD12Q8N8I0 201 aa17.76■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 DTX3Q8N9I9 347 aa17.76■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 ABHD14BQ96IU4 210 aa17.76■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa17.76■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 DIABLOQ9NR28 239 aa17.76■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 RDH8Q9NYR8 311 aa17.76■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa17.76■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 TXNL1O43396 289 aa17.75■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 DIRAS3O95661 229 aa17.75■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 PITPNAQ00169 270 aa17.75■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 HNF4GQ14541 408 aa17.75■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 SPCS2Q15005 226 aa17.75■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 NABP2Q9BQ15 211 aa17.75■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 COMMD3Q9UBI1 195 aa17.75■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 BET1O15155 118 aa17.74■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 HSPA12AO43301 675 aa17.74■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 GNG2P59768 71 aa17.74■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 RPL39P5Q59GN2 51 aa17.74■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 SHISA2Q6UWI4 295 aa17.74■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 PHF21AQ96BD5 680 aa17.74■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 PLSCR3Q9NRY6 295 aa17.74■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 TMEM11P17152 192 aa17.73■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 LSAMPQ13449 338 aa17.73■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 C11orf88Q6PI97 169 aa17.73■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 GVQW1Q8N7I0 195 aa17.73■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 EDARADDQ8WWZ3 215 aa17.73■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 ACOT12Q8WYK0 555 aa17.73■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 CMTM3Q96MX0 182 aa17.73■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 CITED1Q99966 193 aa17.73■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 PRSS22Q9GZN4 317 aa17.73■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 PIPOXQ9P0Z9 390 aa17.73■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 RNF150Q9ULK6 438 aa17.73■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 HAX1O00165 279 aa17.72■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 RAB29O14966 203 aa17.72■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 CT45A6P0DMU7 189 aa17.72■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 CT45A5P0DMU8 189 aa17.72■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 CT45A7P0DMV0 189 aa17.72■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 TMBIM6P55061 237 aa17.72■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 HES1Q14469 280 aa17.72■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 FAM71F2Q6NXP2 309 aa17.72■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 OR2T6Q8NHC8 308 aa17.72■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 HLA-DQB1P01920 261 aa17.72■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 TMEM95Q3KNT9 176 aa17.72■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 ABCA11PQ4W5N1 156 aa17.72■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 C5orf56Q8N8D9 126 aa17.72■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 OR2T10Q8NGZ9 312 aa17.72■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 OR10J5Q8NHC4 309 aa17.72■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 RAB2BQ8WUD1 216 aa17.72■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 AKR1E2Q96JD6 320 aa17.72■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 RITA1Q96K30 269 aa17.72■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 WNT10AQ9GZT5 417 aa17.72■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 GHITMQ9H3K2 345 aa17.72■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 MOB4Q9Y3A3 225 aa17.72■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 HPGDSO60760 199 aa17.71■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 MOSP00540 346 aa17.71■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 APOA1P02647 267 aa17.71■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 LPLP06858 475 aa17.71■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 ELK1P19419 428 aa17.71■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 LINC00205P59089 165 aa17.71■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 TAS2R20P59543 309 aa17.71■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 HOGA1Q86XE5 327 aa17.71■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 C5orf30Q96GV9 206 aa17.71■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 BCL7BQ9BQE9 202 aa17.71■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 ANXA10Q9UJ72 324 aa17.71■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 GAB2Q9UQC2 676 aa17.71■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 CEPT1Q9Y6K0 416 aa17.71■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 FGF16O43320 207 aa17.7■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 F2RL1P55085 397 aa17.7■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 CNIH2Q6PI25 160 aa17.7■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 S1PR3Q99500 378 aa17.7■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 SCOCQ9UIL1 159 aa17.7■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 M0QZK8 103 aa17.69■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 OR8U9P0C7N5 309 aa17.69■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 TMEM69Q5SWH9 247 aa17.69■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 Q8N9W7 124 aa17.69■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 OR8U1Q8NH10 309 aa17.69■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa17.69■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 SNAPC3Q92966 411 aa17.69■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 ANAPC10Q9UM13 185 aa17.69■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 H3BMQ9 156 aa17.68■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 CTXN2P0C2S0 81 aa17.68■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 KLHDC1Q8N7A1 406 aa17.68■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 BEST4Q8NFU0 473 aa17.68■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 OR5AN1Q8NGI8 311 aa17.68■□□□□ 0.42
SYF2-201ENST00000236273 MEIS3P1A6NDR6 274 aa17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms