RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr571E9Q407 322 aa11.25□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mamld1P0C6A2 803 aa11.25□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 KrasP32883 189 aa11.25□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dnase1P49183 284 aa11.25□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zbtb49Q8BXX2 756 aa11.25□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Barx1Q9ER42 254 aa11.25□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ndrg3Q9QYF9 375 aa11.25□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm1330D3Z460 184 aa11.25□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr635K7N6B1 321 aa11.25□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fgf8P37237 268 aa11.25□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tle4Q62441 773 aa11.25□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cxxc4Q6NXI8 198 aa11.25□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mtch2Q791V5 303 aa11.25□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Inpp5kQ8C5L6 468 aa11.25□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GmdsQ8K0C9 372 aa11.25□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tceal3Q8R0A5 200 aa11.25□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q9CQT9 129 aa11.25□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arrdc2Q9D668 407 aa11.25□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sun5Q9DA32 373 aa11.25□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fbxo15Q9QZN0 433 aa11.25□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 FaimQ9WUD8 179 aa11.25□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cacna1iE9Q7P2 2199 aa11.25□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv6-5A0A0A6YWS9 119 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm14403A2BFU4 402 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atpif1O35143 106 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Il9P15247 144 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cxcl3Q6W5C0 100 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1216Q7TR05 311 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc17a5Q8BN82 495 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 B3gnt8Q8R3I9 389 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AldobQ91Y97 364 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcnip3Q9QXT8 256 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcne4Q9WTW3 170 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1406E9Q8X1 310 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PmchP56942 165 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rbp4Q00724 201 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam173aQ501J2 229 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm21093Q6GQS8 569 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wdfy2Q8BUB4 400 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc25a16Q8C0K5 332 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wdr13Q91V09 485 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HaghQ99KB8 309 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RbpmsQ9WVB0 197 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 S1pr3Q9Z0U9 378 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 OtofQ9ESF1 1997 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dmrtb1A2A9I7 359 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp870J3QMA4 560 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AregP31955 248 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gnb1P62874 340 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Col9a1Q05722 921 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tbrg1Q3UB74 406 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Oas1bQ60856 376 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1222Q7TR02 311 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr890Q7TRD9 314 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lax1Q8BHB3 407 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr995Q8VF74 315 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Efcab10Q9D581 132 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Jmjd1cQ69ZK6 2350 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Heatr1G3X9B1 2143 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Obp2bA2BHR0 176 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spsb2O88838 264 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GbaP17439 515 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tnfsf8P32972 239 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hist1h1dP43277 221 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rasl12Q08AT1 266 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm10840Q3V2K9 103 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TMEM229BQ8BFQ2 167 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem218Q9CQ44 115 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Shisa5Q9D7I0 235 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r47Q9EQ51 310 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Syt6Q9R0N8 511 aa11.24□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scml2B1AVB3 969 aa11.23□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm20815J3KMI0 227 aa11.23□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm20914J3QME2 227 aa11.23□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ogg1O08760 345 aa11.23□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm21292Q78EE2 227 aa11.23□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mob1bQ8BPB0 216 aa11.23□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1475Q8VEV6 314 aa11.23□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Defb7Q91V70 71 aa11.23□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mllt1Q9ERL0 547 aa11.23□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ep300B2RWS6 2412 aa11.23□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 8030474K03RikE9Q4Y8 554 aa11.23□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm9772F6XPD8 135 aa11.23□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Snai2P97469 269 aa11.23□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Neil2Q6R2P8 329 aa11.23□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ldlrad4Q8BWJ4 306 aa11.23□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp459Q8BZ17 267 aa11.23□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r62Q8R2C0 300 aa11.23□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr368Q8VF22 327 aa11.23□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1226Q8VGM5 310 aa11.23□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 1700034E13RikQ9D2T6 108 aa11.23□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Reg4Q9D8G5 157 aa11.23□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Abca4O35600 2310 aa11.23□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmsb15aA2AEH9 79 aa11.23□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r83E9Q0G7 864 aa11.23□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wnt2bO70283 389 aa11.23□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AanatO88816 205 aa11.23□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rpl12P35979 165 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hsf1P38532 525 aa11.23□□□□□ -0.61
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cfhr1Q61406 343 aa11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 63.7 ms