RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636331.1

LINC00854-216, Long intergenic non-protein coding RNA 854, human

APPRIS P5 TSL 5 BASIC

Gene LINC00854, Length 718 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00854-216	ENST00000636331	IGHG4	P01861	327 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	CNTFR	P26992	372 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	PSMB8	P28062	276 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	KCNJ3	P48549	501 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	GNB1	P62873	340 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	GNMT	Q14749	295 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	KIR2DS1	Q14954	304 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	PRR18	Q8N4B5	295 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	OR1L1	Q8NH94	360 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	NEK7	Q8TDX7	302 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	KCTD7	Q96MP8	289 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	IL36G	Q9NZH8	169 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	ING4	Q9UNL4	249 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331		G3V318	75 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	AIP	O00170	330 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	MOS	P00540	346 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	UBB	P0CG47	229 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	FABP5	Q01469	135 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	SSX1	Q16384	188 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	AWAT2	Q6E213	333 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	LINC00311	Q8N616	119 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	OR11H1	Q8NG94	326 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	OR4K15	Q8NH41	348 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	RITA1	Q96K30	269 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	IFT22	Q9H7X7	185 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	STUB1	Q9UNE7	303 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	ATP6V0E1	O15342	81 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	LY86	O95711	162 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	MT-ND4	P03905	459 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	ELANE	P08246	267 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	GTF2F2	P13984	249 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	VDAC1	P21796	283 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	SOX6	P35712	828 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	LSAMP	Q13449	338 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	INSL4	Q14641	139 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	LINC00596	Q86U02	117 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	MUL1	Q969V5	352 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	CST11	Q9H112	138 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	GNG12	Q9UBI6	72 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	HBZ	P02008	142 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	CD36	P16671	472 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	CD1B	P29016	333 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	ZNF137P	P52743	207 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	NDP	Q00604	133 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	MMD	Q15546	238 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331		I3L521	148 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	ORC5	O43913	435 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	IGF1	P05019	195 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	GZMH	P20718	246 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	HTR2C	P28335	458 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	MPV17L	Q2QL34	196 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	C22orf42	Q6IC83	251 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	BANF2	Q9H503	90 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LINC00854-216	ENST00000636331	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		11.21	□□□□□ -0.61

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