RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	SHISA3	A0PJX4	238 aa		13.19	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	LANCL1	O43813	399 aa		13.19	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	AMY1A	P04745	511 aa		13.19	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	AMY2A	P04746	511 aa		13.19	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	CD3G	P09693	182 aa		13.19	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZBTB25	P24278	435 aa		13.19	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF137P	P52743	207 aa		13.19	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	EBI3	Q14213	229 aa		13.19	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	NEDD8	Q15843	81 aa		13.19	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		13.19	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		13.19	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		13.19	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		13.19	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	TPRA1	Q86W33	373 aa		13.19	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		13.19	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		13.19	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		13.19	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	SERPINE3	A8MV23	424 aa		13.18	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	LDLRAD4	O15165	306 aa		13.18	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	OPN1MW	P04001	364 aa		13.18	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		13.18	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		13.18	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	RAB6A	P20340	208 aa		13.18	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		13.18	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		13.18	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		13.18	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	KCTD7	Q96MP8	289 aa		13.18	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		13.18	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035		Q9N2K0	584 aa		13.18	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		13.18	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		13.18	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		13.18	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A075B6Q4	140 aa		13.17	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		13.17	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	SMIM30	A4D0T7	59 aa		13.17	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	NOTO	A8MTQ0	251 aa		13.17	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	CEACAM6	P40199	344 aa		13.17	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	HLA-DRB3	P79483	266 aa		13.17	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		13.17	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		13.17	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		13.17	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		13.17	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	R3HDM4	Q96D70	268 aa		13.17	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR4F4	Q96R69	305 aa		13.17	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	S1PR3	Q99500	378 aa		13.17	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		13.17	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		13.17	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR51E2	Q9H255	320 aa		13.17	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	GHITM	Q9H3K2	345 aa		13.17	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	ANK2	Q01484	3957 aa		13.17	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		13.16	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	PSMB11	A5LHX3	300 aa		13.16	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	RAB29	O14966	203 aa		13.16	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	CD36	P16671	472 aa		13.16	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	TALDO1	P37837	337 aa		13.16	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC35B1	P78383	322 aa		13.16	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLA2G7	Q13093	441 aa		13.16	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARFRP1	Q13795	201 aa		13.16	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARL6IP1	Q15041	203 aa		13.16	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		13.16	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		13.16	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	PTX4	Q96A99	478 aa		13.16	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		13.16	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A0B4J203	849 aa		13.15	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A1W2PRX2	142 aa		13.15	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRDC	B7Z8K6	153 aa		13.15	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	ST8SIA5	O15466	376 aa		13.15	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	SCT	P09683	121 aa		13.15	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	GNB3	P16520	340 aa		13.15	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	CD83	Q01151	205 aa		13.15	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	LSAMP	Q13449	338 aa		13.15	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		13.15	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A087WXM4	84 aa		13.14	□□□□□ -0.31
JMJD1C-211	ENST00000633035	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		13.14	□□□□□ -0.31
JMJD1C-211	ENST00000633035	ITGB1BP1	O14713	200 aa		13.14	□□□□□ -0.31
JMJD1C-211	ENST00000633035	TNFAIP8	O95379	198 aa		13.14	□□□□□ -0.31
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGHG2	P01859	326 aa		13.14	□□□□□ -0.31
JMJD1C-211	ENST00000633035	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
JMJD1C-211	ENST00000633035	PF4V1	P10720	104 aa		13.14	□□□□□ -0.31
JMJD1C-211	ENST00000633035	SDC2	P34741	201 aa		13.14	□□□□□ -0.31
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR3A3	P47888	321 aa		13.14	□□□□□ -0.31
JMJD1C-211	ENST00000633035	SERPINB10	P48595	397 aa		13.14	□□□□□ -0.31
JMJD1C-211	ENST00000633035	MXD1	Q05195	221 aa		13.14	□□□□□ -0.31
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIR2DS1	Q14954	304 aa		13.14	□□□□□ -0.31
JMJD1C-211	ENST00000633035	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		13.14	□□□□□ -0.31
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		13.14	□□□□□ -0.31
JMJD1C-211	ENST00000633035		Q6ZPA2	131 aa		13.14	□□□□□ -0.31
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		13.14	□□□□□ -0.31
JMJD1C-211	ENST00000633035	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		13.14	□□□□□ -0.31
JMJD1C-211	ENST00000633035		Q8N6K4	173 aa		13.14	□□□□□ -0.31
JMJD1C-211	ENST00000633035		Q8N9W7	124 aa		13.14	□□□□□ -0.31
JMJD1C-211	ENST00000633035	PHF21A	Q96BD5	680 aa		13.14	□□□□□ -0.31

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